Protein–RNA interactions for Protein: P04280

PRB1, Basic salivary proline-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRB1P04280 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PRB1P04280 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRB1P04280 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRB1P04280 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PRB1P04280 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRB1P04280 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRB1P04280 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRB1P04280 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRB1P04280 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRB1P04280 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PRB1P04280 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRB1P04280 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRB1P04280 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRB1P04280 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRB1P04280 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRB1P04280 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRB1P04280 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRB1P04280 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRB1P04280 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRB1P04280 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRB1P04280 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRB1P04280 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRB1P04280 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRB1P04280 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRB1P04280 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRB1P04280 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRB1P04280 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PRB1P04280 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRB1P04280 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRB1P04280 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRB1P04280 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PRB1P04280 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PRB1P04280 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PRB1P04280 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PRB1P04280 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PRB1P04280 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRB1P04280 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRB1P04280 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRB1P04280 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRB1P04280 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRB1P04280 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRB1P04280 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRB1P04280 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRB1P04280 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRB1P04280 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRB1P04280 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRB1P04280 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRB1P04280 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRB1P04280 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRB1P04280 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRB1P04280 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRB1P04280 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRB1P04280 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRB1P04280 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRB1P04280 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRB1P04280 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRB1P04280 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRB1P04280 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRB1P04280 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRB1P04280 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRB1P04280 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRB1P04280 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRB1P04280 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRB1P04280 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PRB1P04280 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRB1P04280 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PRB1P04280 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PRB1P04280 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRB1P04280 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRB1P04280 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRB1P04280 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRB1P04280 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRB1P04280 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PRB1P04280 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRB1P04280 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PRB1P04280 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRB1P04280 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRB1P04280 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRB1P04280 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRB1P04280 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRB1P04280 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRB1P04280 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRB1P04280 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRB1P04280 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRB1P04280 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRB1P04280 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRB1P04280 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRB1P04280 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRB1P04280 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRB1P04280 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRB1P04280 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRB1P04280 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRB1P04280 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRB1P04280 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRB1P04280 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRB1P04280 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRB1P04280 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRB1P04280 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PRB1P04280 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRB1P04280 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms