Protein–RNA interactions for Protein: O95486

SEC24A, Protein transport protein Sec24A, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24AO95486 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SEC24AO95486 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SEC24AO95486 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SEC24AO95486 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SEC24AO95486 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SEC24AO95486 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SEC24AO95486 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SEC24AO95486 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SEC24AO95486 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SEC24AO95486 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SEC24AO95486 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SEC24AO95486 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SEC24AO95486 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SEC24AO95486 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SEC24AO95486 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SEC24AO95486 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SEC24AO95486 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SEC24AO95486 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SEC24AO95486 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SEC24AO95486 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SEC24AO95486 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SEC24AO95486 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SEC24AO95486 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SEC24AO95486 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SEC24AO95486 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SEC24AO95486 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SEC24AO95486 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SEC24AO95486 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SEC24AO95486 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SEC24AO95486 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SEC24AO95486 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SEC24AO95486 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SEC24AO95486 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SEC24AO95486 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SEC24AO95486 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SEC24AO95486 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SEC24AO95486 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SEC24AO95486 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SEC24AO95486 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SEC24AO95486 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SEC24AO95486 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SEC24AO95486 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SEC24AO95486 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SEC24AO95486 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SEC24AO95486 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SEC24AO95486 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SEC24AO95486 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SEC24AO95486 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SEC24AO95486 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SEC24AO95486 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SEC24AO95486 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SEC24AO95486 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SEC24AO95486 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SEC24AO95486 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SEC24AO95486 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SEC24AO95486 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SEC24AO95486 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SEC24AO95486 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SEC24AO95486 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SEC24AO95486 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SEC24AO95486 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SEC24AO95486 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SEC24AO95486 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SEC24AO95486 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SEC24AO95486 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SEC24AO95486 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SEC24AO95486 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SEC24AO95486 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SEC24AO95486 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SEC24AO95486 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SEC24AO95486 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SEC24AO95486 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SEC24AO95486 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SEC24AO95486 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SEC24AO95486 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SEC24AO95486 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SEC24AO95486 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SEC24AO95486 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SEC24AO95486 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SEC24AO95486 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SEC24AO95486 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SEC24AO95486 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SEC24AO95486 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SEC24AO95486 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SEC24AO95486 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SEC24AO95486 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SEC24AO95486 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SEC24AO95486 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SEC24AO95486 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SEC24AO95486 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SEC24AO95486 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SEC24AO95486 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SEC24AO95486 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SEC24AO95486 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SEC24AO95486 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SEC24AO95486 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SEC24AO95486 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SEC24AO95486 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SEC24AO95486 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SEC24AO95486 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms