Protein–RNA interactions for Protein: O75683

SURF6, Surfeit locus protein 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SURF6O75683 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SURF6O75683 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SURF6O75683 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SURF6O75683 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SURF6O75683 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SURF6O75683 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SURF6O75683 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SURF6O75683 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SURF6O75683 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SURF6O75683 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SURF6O75683 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SURF6O75683 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SURF6O75683 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SURF6O75683 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SURF6O75683 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SURF6O75683 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SURF6O75683 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SURF6O75683 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SURF6O75683 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SURF6O75683 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SURF6O75683 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SURF6O75683 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SURF6O75683 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SURF6O75683 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SURF6O75683 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SURF6O75683 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SURF6O75683 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SURF6O75683 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SURF6O75683 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SURF6O75683 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SURF6O75683 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SURF6O75683 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SURF6O75683 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SURF6O75683 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SURF6O75683 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SURF6O75683 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SURF6O75683 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SURF6O75683 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SURF6O75683 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SURF6O75683 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SURF6O75683 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SURF6O75683 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SURF6O75683 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SURF6O75683 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SURF6O75683 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SURF6O75683 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SURF6O75683 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SURF6O75683 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SURF6O75683 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SURF6O75683 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SURF6O75683 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SURF6O75683 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SURF6O75683 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SURF6O75683 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SURF6O75683 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SURF6O75683 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SURF6O75683 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SURF6O75683 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SURF6O75683 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SURF6O75683 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SURF6O75683 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SURF6O75683 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SURF6O75683 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SURF6O75683 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SURF6O75683 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SURF6O75683 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SURF6O75683 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SURF6O75683 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SURF6O75683 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SURF6O75683 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SURF6O75683 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SURF6O75683 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SURF6O75683 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SURF6O75683 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SURF6O75683 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SURF6O75683 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SURF6O75683 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SURF6O75683 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SURF6O75683 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SURF6O75683 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SURF6O75683 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SURF6O75683 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SURF6O75683 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SURF6O75683 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SURF6O75683 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SURF6O75683 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SURF6O75683 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SURF6O75683 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SURF6O75683 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SURF6O75683 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SURF6O75683 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SURF6O75683 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SURF6O75683 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SURF6O75683 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SURF6O75683 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SURF6O75683 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SURF6O75683 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SURF6O75683 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SURF6O75683 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SURF6O75683 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms