Protein–RNA interactions for Protein: O60437

PPL, Periplakin, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPLO60437 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PPLO60437 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PPLO60437 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PPLO60437 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PPLO60437 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PPLO60437 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PPLO60437 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PPLO60437 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PPLO60437 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PPLO60437 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PPLO60437 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PPLO60437 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PPLO60437 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PPLO60437 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PPLO60437 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PPLO60437 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PPLO60437 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PPLO60437 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PPLO60437 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PPLO60437 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PPLO60437 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PPLO60437 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PPLO60437 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PPLO60437 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PPLO60437 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PPLO60437 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PPLO60437 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PPLO60437 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PPLO60437 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PPLO60437 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PPLO60437 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PPLO60437 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PPLO60437 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PPLO60437 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PPLO60437 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PPLO60437 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PPLO60437 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PPLO60437 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PPLO60437 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PPLO60437 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PPLO60437 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PPLO60437 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PPLO60437 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PPLO60437 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PPLO60437 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PPLO60437 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PPLO60437 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PPLO60437 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PPLO60437 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PPLO60437 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PPLO60437 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PPLO60437 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PPLO60437 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PPLO60437 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PPLO60437 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PPLO60437 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PPLO60437 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PPLO60437 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PPLO60437 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PPLO60437 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PPLO60437 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PPLO60437 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PPLO60437 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PPLO60437 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PPLO60437 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PPLO60437 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PPLO60437 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PPLO60437 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PPLO60437 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PPLO60437 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PPLO60437 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PPLO60437 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PPLO60437 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PPLO60437 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PPLO60437 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PPLO60437 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PPLO60437 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PPLO60437 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PPLO60437 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PPLO60437 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PPLO60437 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PPLO60437 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PPLO60437 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PPLO60437 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PPLO60437 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PPLO60437 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PPLO60437 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PPLO60437 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PPLO60437 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PPLO60437 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PPLO60437 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PPLO60437 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PPLO60437 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PPLO60437 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PPLO60437 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PPLO60437 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PPLO60437 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PPLO60437 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PPLO60437 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PPLO60437 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms