Protein–RNA interactions for Protein: O60296

TRAK2, Trafficking kinesin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK2O60296 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAK2O60296 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAK2O60296 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAK2O60296 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAK2O60296 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAK2O60296 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAK2O60296 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAK2O60296 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAK2O60296 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAK2O60296 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAK2O60296 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAK2O60296 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAK2O60296 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAK2O60296 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAK2O60296 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAK2O60296 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAK2O60296 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAK2O60296 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAK2O60296 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAK2O60296 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAK2O60296 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAK2O60296 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAK2O60296 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAK2O60296 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAK2O60296 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAK2O60296 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAK2O60296 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAK2O60296 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAK2O60296 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAK2O60296 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAK2O60296 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAK2O60296 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAK2O60296 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAK2O60296 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAK2O60296 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAK2O60296 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAK2O60296 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAK2O60296 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAK2O60296 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRAK2O60296 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRAK2O60296 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRAK2O60296 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRAK2O60296 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRAK2O60296 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRAK2O60296 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRAK2O60296 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRAK2O60296 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRAK2O60296 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRAK2O60296 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRAK2O60296 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRAK2O60296 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRAK2O60296 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TRAK2O60296 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRAK2O60296 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRAK2O60296 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRAK2O60296 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRAK2O60296 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRAK2O60296 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRAK2O60296 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRAK2O60296 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRAK2O60296 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRAK2O60296 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRAK2O60296 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRAK2O60296 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRAK2O60296 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRAK2O60296 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRAK2O60296 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAK2O60296 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAK2O60296 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAK2O60296 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAK2O60296 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAK2O60296 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAK2O60296 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAK2O60296 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAK2O60296 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAK2O60296 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAK2O60296 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAK2O60296 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAK2O60296 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAK2O60296 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAK2O60296 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAK2O60296 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAK2O60296 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAK2O60296 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAK2O60296 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAK2O60296 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAK2O60296 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAK2O60296 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAK2O60296 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAK2O60296 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAK2O60296 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAK2O60296 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAK2O60296 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAK2O60296 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAK2O60296 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAK2O60296 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAK2O60296 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAK2O60296 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAK2O60296 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAK2O60296 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms