Protein–RNA interactions for Protein: O43196

MSH5, MutS protein homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSH5O43196 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MSH5O43196 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MSH5O43196 AC104162.1-204ENST00000443346 708 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MSH5O43196 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MSH5O43196 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MSH5O43196 AC103808.1-201ENST00000579833 922 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MSH5O43196 IL31RA-208ENST00000611895 1171 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MSH5O43196 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MSH5O43196 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MSH5O43196 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MSH5O43196 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MSH5O43196 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MSH5O43196 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MSH5O43196 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MSH5O43196 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MSH5O43196 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MSH5O43196 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
MSH5O43196 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MSH5O43196 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MSH5O43196 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MSH5O43196 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MSH5O43196 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MSH5O43196 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MSH5O43196 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MSH5O43196 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MSH5O43196 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MSH5O43196 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
MSH5O43196 AC124069.1-201ENST00000517454 735 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MSH5O43196 AC087289.4-201ENST00000587348 230 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MSH5O43196 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
MSH5O43196 AL035425.4-201ENST00000624509 1063 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
MSH5O43196 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MSH5O43196 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MSH5O43196 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MSH5O43196 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MSH5O43196 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MSH5O43196 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
MSH5O43196 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MSH5O43196 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MSH5O43196 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MSH5O43196 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
MSH5O43196 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
MSH5O43196 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MSH5O43196 FAM122C-202ENST00000370785 1344 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MSH5O43196 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MSH5O43196 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MSH5O43196 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MSH5O43196 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MSH5O43196 DAD1-201ENST00000250498 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MSH5O43196 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MSH5O43196 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MSH5O43196 AL590727.1-201ENST00000418652 771 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MSH5O43196 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MSH5O43196 AL356361.2-201ENST00000430542 443 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MSH5O43196 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
MSH5O43196 IL22-202ENST00000538666 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MSH5O43196 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
MSH5O43196 AC090330.1-201ENST00000588646 764 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
MSH5O43196 AC090116.1-201ENST00000615679 446 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
MSH5O43196 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MSH5O43196 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
MSH5O43196 LINC00836-203ENST00000628620 1179 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MSH5O43196 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MSH5O43196 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MSH5O43196 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MSH5O43196 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MSH5O43196 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MSH5O43196 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MSH5O43196 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MSH5O43196 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MSH5O43196 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MSH5O43196 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MSH5O43196 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MSH5O43196 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MSH5O43196 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MSH5O43196 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MSH5O43196 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MSH5O43196 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
MSH5O43196 AL627171.1-201ENST00000618845 1308 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
MSH5O43196 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MSH5O43196 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MSH5O43196 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MSH5O43196 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MSH5O43196 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MSH5O43196 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MSH5O43196 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MSH5O43196 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MSH5O43196 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MSH5O43196 ZSWIM7-209ENST00000486655 726 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MSH5O43196 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
MSH5O43196 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
MSH5O43196 SMIM8-207ENST00000608525 735 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MSH5O43196 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MSH5O43196 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MSH5O43196 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MSH5O43196 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MSH5O43196 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MSH5O43196 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MSH5O43196 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MSH5O43196 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms