Protein–RNA interactions for Protein: O15205

UBD, Ubiquitin D, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBDO15205 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
UBDO15205 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
UBDO15205 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
UBDO15205 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
UBDO15205 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
UBDO15205 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
UBDO15205 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
UBDO15205 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
UBDO15205 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
UBDO15205 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
UBDO15205 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
UBDO15205 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
UBDO15205 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
UBDO15205 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
UBDO15205 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
UBDO15205 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
UBDO15205 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
UBDO15205 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
UBDO15205 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
UBDO15205 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
UBDO15205 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
UBDO15205 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
UBDO15205 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
UBDO15205 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
UBDO15205 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
UBDO15205 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
UBDO15205 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
UBDO15205 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
UBDO15205 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
UBDO15205 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
UBDO15205 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
UBDO15205 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
UBDO15205 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
UBDO15205 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
UBDO15205 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
UBDO15205 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
UBDO15205 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
UBDO15205 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
UBDO15205 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
UBDO15205 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
UBDO15205 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
UBDO15205 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
UBDO15205 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
UBDO15205 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
UBDO15205 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
UBDO15205 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
UBDO15205 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
UBDO15205 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
UBDO15205 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
UBDO15205 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
UBDO15205 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
UBDO15205 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
UBDO15205 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
UBDO15205 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
UBDO15205 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
UBDO15205 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
UBDO15205 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
UBDO15205 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
UBDO15205 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
UBDO15205 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
UBDO15205 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
UBDO15205 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
UBDO15205 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
UBDO15205 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
UBDO15205 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
UBDO15205 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
UBDO15205 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
UBDO15205 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
UBDO15205 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
UBDO15205 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
UBDO15205 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
UBDO15205 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
UBDO15205 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
UBDO15205 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
UBDO15205 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
UBDO15205 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
UBDO15205 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
UBDO15205 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
UBDO15205 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
UBDO15205 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
UBDO15205 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
UBDO15205 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
UBDO15205 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
UBDO15205 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
UBDO15205 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
UBDO15205 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
UBDO15205 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
UBDO15205 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
UBDO15205 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
UBDO15205 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
UBDO15205 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
UBDO15205 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
UBDO15205 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
UBDO15205 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
UBDO15205 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
UBDO15205 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
UBDO15205 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
UBDO15205 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
UBDO15205 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
UBDO15205 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms