Protein–RNA interactions for Protein: O15084

ANKRD28, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory ankyrin repeat subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28O15084 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ANKRD28O15084 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ANKRD28O15084 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ANKRD28O15084 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ANKRD28O15084 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ANKRD28O15084 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ANKRD28O15084 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ANKRD28O15084 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ANKRD28O15084 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ANKRD28O15084 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ANKRD28O15084 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ANKRD28O15084 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ANKRD28O15084 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ANKRD28O15084 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ANKRD28O15084 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ANKRD28O15084 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ANKRD28O15084 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ANKRD28O15084 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ANKRD28O15084 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ANKRD28O15084 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ANKRD28O15084 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ANKRD28O15084 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ANKRD28O15084 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ANKRD28O15084 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ANKRD28O15084 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ANKRD28O15084 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ANKRD28O15084 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ANKRD28O15084 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ANKRD28O15084 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ANKRD28O15084 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ANKRD28O15084 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ANKRD28O15084 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ANKRD28O15084 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ANKRD28O15084 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ANKRD28O15084 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ANKRD28O15084 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ANKRD28O15084 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ANKRD28O15084 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ANKRD28O15084 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ANKRD28O15084 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ANKRD28O15084 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ANKRD28O15084 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ANKRD28O15084 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ANKRD28O15084 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ANKRD28O15084 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ANKRD28O15084 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ANKRD28O15084 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ANKRD28O15084 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ANKRD28O15084 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ANKRD28O15084 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ANKRD28O15084 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ANKRD28O15084 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ANKRD28O15084 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ANKRD28O15084 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ANKRD28O15084 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ANKRD28O15084 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ANKRD28O15084 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ANKRD28O15084 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ANKRD28O15084 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ANKRD28O15084 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ANKRD28O15084 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ANKRD28O15084 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ANKRD28O15084 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ANKRD28O15084 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ANKRD28O15084 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ANKRD28O15084 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ANKRD28O15084 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ANKRD28O15084 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ANKRD28O15084 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ANKRD28O15084 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ANKRD28O15084 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ANKRD28O15084 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ANKRD28O15084 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ANKRD28O15084 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ANKRD28O15084 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ANKRD28O15084 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ANKRD28O15084 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ANKRD28O15084 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ANKRD28O15084 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ANKRD28O15084 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ANKRD28O15084 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ANKRD28O15084 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ANKRD28O15084 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ANKRD28O15084 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ANKRD28O15084 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ANKRD28O15084 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ANKRD28O15084 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ANKRD28O15084 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ANKRD28O15084 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ANKRD28O15084 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ANKRD28O15084 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ANKRD28O15084 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ANKRD28O15084 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ANKRD28O15084 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ANKRD28O15084 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ANKRD28O15084 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ANKRD28O15084 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ANKRD28O15084 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ANKRD28O15084 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ANKRD28O15084 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms