Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOC4-APOC2K7ER74 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOC4-APOC2K7ER74 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOC4-APOC2K7ER74 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOC4-APOC2K7ER74 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOC4-APOC2K7ER74 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOC4-APOC2K7ER74 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOC4-APOC2K7ER74 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOC4-APOC2K7ER74 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOC4-APOC2K7ER74 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
APOC4-APOC2K7ER74 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOC4-APOC2K7ER74 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOC4-APOC2K7ER74 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOC4-APOC2K7ER74 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOC4-APOC2K7ER74 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOC4-APOC2K7ER74 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOC4-APOC2K7ER74 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOC4-APOC2K7ER74 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOC4-APOC2K7ER74 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
APOC4-APOC2K7ER74 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOC4-APOC2K7ER74 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOC4-APOC2K7ER74 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOC4-APOC2K7ER74 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOC4-APOC2K7ER74 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOC4-APOC2K7ER74 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOC4-APOC2K7ER74 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOC4-APOC2K7ER74 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
APOC4-APOC2K7ER74 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOC4-APOC2K7ER74 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOC4-APOC2K7ER74 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOC4-APOC2K7ER74 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOC4-APOC2K7ER74 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOC4-APOC2K7ER74 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOC4-APOC2K7ER74 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOC4-APOC2K7ER74 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOC4-APOC2K7ER74 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOC4-APOC2K7ER74 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOC4-APOC2K7ER74 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOC4-APOC2K7ER74 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOC4-APOC2K7ER74 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOC4-APOC2K7ER74 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOC4-APOC2K7ER74 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOC4-APOC2K7ER74 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOC4-APOC2K7ER74 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
APOC4-APOC2K7ER74 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOC4-APOC2K7ER74 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOC4-APOC2K7ER74 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOC4-APOC2K7ER74 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOC4-APOC2K7ER74 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOC4-APOC2K7ER74 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOC4-APOC2K7ER74 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOC4-APOC2K7ER74 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOC4-APOC2K7ER74 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOC4-APOC2K7ER74 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOC4-APOC2K7ER74 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOC4-APOC2K7ER74 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOC4-APOC2K7ER74 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOC4-APOC2K7ER74 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOC4-APOC2K7ER74 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOC4-APOC2K7ER74 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOC4-APOC2K7ER74 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOC4-APOC2K7ER74 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOC4-APOC2K7ER74 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOC4-APOC2K7ER74 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOC4-APOC2K7ER74 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOC4-APOC2K7ER74 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOC4-APOC2K7ER74 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOC4-APOC2K7ER74 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOC4-APOC2K7ER74 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOC4-APOC2K7ER74 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOC4-APOC2K7ER74 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
APOC4-APOC2K7ER74 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOC4-APOC2K7ER74 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOC4-APOC2K7ER74 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOC4-APOC2K7ER74 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOC4-APOC2K7ER74 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOC4-APOC2K7ER74 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOC4-APOC2K7ER74 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOC4-APOC2K7ER74 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOC4-APOC2K7ER74 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOC4-APOC2K7ER74 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOC4-APOC2K7ER74 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOC4-APOC2K7ER74 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOC4-APOC2K7ER74 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOC4-APOC2K7ER74 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOC4-APOC2K7ER74 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOC4-APOC2K7ER74 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOC4-APOC2K7ER74 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOC4-APOC2K7ER74 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOC4-APOC2K7ER74 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOC4-APOC2K7ER74 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
APOC4-APOC2K7ER74 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms