Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HMGB1P1B2RPK0 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HMGB1P1B2RPK0 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HMGB1P1B2RPK0 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HMGB1P1B2RPK0 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HMGB1P1B2RPK0 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HMGB1P1B2RPK0 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HMGB1P1B2RPK0 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HMGB1P1B2RPK0 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
HMGB1P1B2RPK0 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HMGB1P1B2RPK0 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HMGB1P1B2RPK0 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HMGB1P1B2RPK0 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HMGB1P1B2RPK0 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HMGB1P1B2RPK0 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HMGB1P1B2RPK0 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HMGB1P1B2RPK0 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
HMGB1P1B2RPK0 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HMGB1P1B2RPK0 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HMGB1P1B2RPK0 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HMGB1P1B2RPK0 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HMGB1P1B2RPK0 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HMGB1P1B2RPK0 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HMGB1P1B2RPK0 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HMGB1P1B2RPK0 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HMGB1P1B2RPK0 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HMGB1P1B2RPK0 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HMGB1P1B2RPK0 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HMGB1P1B2RPK0 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HMGB1P1B2RPK0 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HMGB1P1B2RPK0 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HMGB1P1B2RPK0 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HMGB1P1B2RPK0 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HMGB1P1B2RPK0 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HMGB1P1B2RPK0 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HMGB1P1B2RPK0 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HMGB1P1B2RPK0 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HMGB1P1B2RPK0 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HMGB1P1B2RPK0 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HMGB1P1B2RPK0 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HMGB1P1B2RPK0 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HMGB1P1B2RPK0 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HMGB1P1B2RPK0 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HMGB1P1B2RPK0 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HMGB1P1B2RPK0 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HMGB1P1B2RPK0 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HMGB1P1B2RPK0 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HMGB1P1B2RPK0 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HMGB1P1B2RPK0 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HMGB1P1B2RPK0 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HMGB1P1B2RPK0 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HMGB1P1B2RPK0 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HMGB1P1B2RPK0 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HMGB1P1B2RPK0 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HMGB1P1B2RPK0 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HMGB1P1B2RPK0 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HMGB1P1B2RPK0 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HMGB1P1B2RPK0 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HMGB1P1B2RPK0 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HMGB1P1B2RPK0 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HMGB1P1B2RPK0 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HMGB1P1B2RPK0 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HMGB1P1B2RPK0 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HMGB1P1B2RPK0 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HMGB1P1B2RPK0 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HMGB1P1B2RPK0 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HMGB1P1B2RPK0 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HMGB1P1B2RPK0 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HMGB1P1B2RPK0 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HMGB1P1B2RPK0 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HMGB1P1B2RPK0 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HMGB1P1B2RPK0 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HMGB1P1B2RPK0 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HMGB1P1B2RPK0 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HMGB1P1B2RPK0 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HMGB1P1B2RPK0 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HMGB1P1B2RPK0 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HMGB1P1B2RPK0 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HMGB1P1B2RPK0 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HMGB1P1B2RPK0 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HMGB1P1B2RPK0 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HMGB1P1B2RPK0 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HMGB1P1B2RPK0 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HMGB1P1B2RPK0 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HMGB1P1B2RPK0 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HMGB1P1B2RPK0 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HMGB1P1B2RPK0 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HMGB1P1B2RPK0 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HMGB1P1B2RPK0 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HMGB1P1B2RPK0 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HMGB1P1B2RPK0 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HMGB1P1B2RPK0 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HMGB1P1B2RPK0 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HMGB1P1B2RPK0 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HMGB1P1B2RPK0 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HMGB1P1B2RPK0 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HMGB1P1B2RPK0 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HMGB1P1B2RPK0 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HMGB1P1B2RPK0 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HMGB1P1B2RPK0 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms