Protein–RNA interactions for Protein: B2RD01

CENPBD1, CENPB DNA-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBD1B2RD01 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CENPBD1B2RD01 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CENPBD1B2RD01 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CENPBD1B2RD01 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CENPBD1B2RD01 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CENPBD1B2RD01 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CENPBD1B2RD01 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CENPBD1B2RD01 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CENPBD1B2RD01 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CENPBD1B2RD01 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CENPBD1B2RD01 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CENPBD1B2RD01 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CENPBD1B2RD01 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CENPBD1B2RD01 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CENPBD1B2RD01 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CENPBD1B2RD01 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CENPBD1B2RD01 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CENPBD1B2RD01 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CENPBD1B2RD01 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CENPBD1B2RD01 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CENPBD1B2RD01 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CENPBD1B2RD01 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CENPBD1B2RD01 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CENPBD1B2RD01 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CENPBD1B2RD01 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CENPBD1B2RD01 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CENPBD1B2RD01 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CENPBD1B2RD01 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CENPBD1B2RD01 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CENPBD1B2RD01 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CENPBD1B2RD01 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CENPBD1B2RD01 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CENPBD1B2RD01 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CENPBD1B2RD01 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CENPBD1B2RD01 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CENPBD1B2RD01 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CENPBD1B2RD01 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CENPBD1B2RD01 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CENPBD1B2RD01 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CENPBD1B2RD01 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CENPBD1B2RD01 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CENPBD1B2RD01 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CENPBD1B2RD01 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPBD1B2RD01 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPBD1B2RD01 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPBD1B2RD01 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPBD1B2RD01 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPBD1B2RD01 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPBD1B2RD01 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPBD1B2RD01 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPBD1B2RD01 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPBD1B2RD01 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPBD1B2RD01 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPBD1B2RD01 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPBD1B2RD01 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPBD1B2RD01 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPBD1B2RD01 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPBD1B2RD01 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPBD1B2RD01 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPBD1B2RD01 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPBD1B2RD01 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPBD1B2RD01 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPBD1B2RD01 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPBD1B2RD01 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPBD1B2RD01 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPBD1B2RD01 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPBD1B2RD01 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPBD1B2RD01 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPBD1B2RD01 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPBD1B2RD01 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPBD1B2RD01 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPBD1B2RD01 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPBD1B2RD01 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPBD1B2RD01 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPBD1B2RD01 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPBD1B2RD01 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPBD1B2RD01 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CENPBD1B2RD01 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CENPBD1B2RD01 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CENPBD1B2RD01 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CENPBD1B2RD01 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CENPBD1B2RD01 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CENPBD1B2RD01 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CENPBD1B2RD01 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CENPBD1B2RD01 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CENPBD1B2RD01 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CENPBD1B2RD01 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CENPBD1B2RD01 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CENPBD1B2RD01 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CENPBD1B2RD01 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CENPBD1B2RD01 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CENPBD1B2RD01 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CENPBD1B2RD01 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CENPBD1B2RD01 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CENPBD1B2RD01 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CENPBD1B2RD01 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CENPBD1B2RD01 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CENPBD1B2RD01 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CENPBD1B2RD01 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CENPBD1B2RD01 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.3 ms