Protein–RNA interactions for Protein: A6NI79

CCDC69, Coiled-coil domain-containing protein 69, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC69A6NI79 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC69A6NI79 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC69A6NI79 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC69A6NI79 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC69A6NI79 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC69A6NI79 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC69A6NI79 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC69A6NI79 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC69A6NI79 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC69A6NI79 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC69A6NI79 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC69A6NI79 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC69A6NI79 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC69A6NI79 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC69A6NI79 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC69A6NI79 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC69A6NI79 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC69A6NI79 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC69A6NI79 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC69A6NI79 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC69A6NI79 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC69A6NI79 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC69A6NI79 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC69A6NI79 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC69A6NI79 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC69A6NI79 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC69A6NI79 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC69A6NI79 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC69A6NI79 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC69A6NI79 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC69A6NI79 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC69A6NI79 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC69A6NI79 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC69A6NI79 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC69A6NI79 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC69A6NI79 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC69A6NI79 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC69A6NI79 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC69A6NI79 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC69A6NI79 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC69A6NI79 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC69A6NI79 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC69A6NI79 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC69A6NI79 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC69A6NI79 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC69A6NI79 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC69A6NI79 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC69A6NI79 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC69A6NI79 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC69A6NI79 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC69A6NI79 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC69A6NI79 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC69A6NI79 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC69A6NI79 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC69A6NI79 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC69A6NI79 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC69A6NI79 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC69A6NI79 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC69A6NI79 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC69A6NI79 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC69A6NI79 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC69A6NI79 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC69A6NI79 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC69A6NI79 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC69A6NI79 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC69A6NI79 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC69A6NI79 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC69A6NI79 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC69A6NI79 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC69A6NI79 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC69A6NI79 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC69A6NI79 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC69A6NI79 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC69A6NI79 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC69A6NI79 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC69A6NI79 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC69A6NI79 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC69A6NI79 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC69A6NI79 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC69A6NI79 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC69A6NI79 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC69A6NI79 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC69A6NI79 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC69A6NI79 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC69A6NI79 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC69A6NI79 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC69A6NI79 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC69A6NI79 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC69A6NI79 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC69A6NI79 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC69A6NI79 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC69A6NI79 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC69A6NI79 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC69A6NI79 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC69A6NI79 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC69A6NI79 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC69A6NI79 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC69A6NI79 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC69A6NI79 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC69A6NI79 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms