Protein–RNA interactions for Protein: V9GXZ4

FPGT-TNNI3K, FPGT-TNNI3K readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 949 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms