Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5J5

PHLDA3, Pleckstrin homology-like domain family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHLDA3Q9Y5J5 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms