Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Y2

CHTOP, Chromatin target of PRMT1 protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTOPQ9Y3Y2 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 SENP3-202ENST00000429205 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 TOR1AIP1-201ENST00000271583 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms