Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W7

KCNIP3, Calsenilin, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP3Q9Y2W7 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms