Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ3

HPS5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS5Q9UPZ3 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HPS5Q9UPZ3 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HPS5Q9UPZ3 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HPS5Q9UPZ3 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
HPS5Q9UPZ3 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
HPS5Q9UPZ3 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HPS5Q9UPZ3 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HPS5Q9UPZ3 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HPS5Q9UPZ3 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HPS5Q9UPZ3 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
HPS5Q9UPZ3 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
HPS5Q9UPZ3 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HPS5Q9UPZ3 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HPS5Q9UPZ3 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HPS5Q9UPZ3 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HPS5Q9UPZ3 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HPS5Q9UPZ3 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HPS5Q9UPZ3 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HPS5Q9UPZ3 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HPS5Q9UPZ3 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
HPS5Q9UPZ3 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HPS5Q9UPZ3 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HPS5Q9UPZ3 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HPS5Q9UPZ3 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HPS5Q9UPZ3 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HPS5Q9UPZ3 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HPS5Q9UPZ3 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HPS5Q9UPZ3 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HPS5Q9UPZ3 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HPS5Q9UPZ3 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HPS5Q9UPZ3 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HPS5Q9UPZ3 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HPS5Q9UPZ3 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HPS5Q9UPZ3 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HPS5Q9UPZ3 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
HPS5Q9UPZ3 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
HPS5Q9UPZ3 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
HPS5Q9UPZ3 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
HPS5Q9UPZ3 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HPS5Q9UPZ3 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HPS5Q9UPZ3 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HPS5Q9UPZ3 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HPS5Q9UPZ3 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HPS5Q9UPZ3 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HPS5Q9UPZ3 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HPS5Q9UPZ3 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HPS5Q9UPZ3 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HPS5Q9UPZ3 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HPS5Q9UPZ3 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HPS5Q9UPZ3 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
HPS5Q9UPZ3 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HPS5Q9UPZ3 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HPS5Q9UPZ3 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HPS5Q9UPZ3 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HPS5Q9UPZ3 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HPS5Q9UPZ3 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HPS5Q9UPZ3 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HPS5Q9UPZ3 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HPS5Q9UPZ3 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HPS5Q9UPZ3 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HPS5Q9UPZ3 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HPS5Q9UPZ3 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HPS5Q9UPZ3 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HPS5Q9UPZ3 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HPS5Q9UPZ3 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HPS5Q9UPZ3 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HPS5Q9UPZ3 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HPS5Q9UPZ3 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HPS5Q9UPZ3 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HPS5Q9UPZ3 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HPS5Q9UPZ3 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HPS5Q9UPZ3 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HPS5Q9UPZ3 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HPS5Q9UPZ3 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HPS5Q9UPZ3 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HPS5Q9UPZ3 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HPS5Q9UPZ3 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HPS5Q9UPZ3 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HPS5Q9UPZ3 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HPS5Q9UPZ3 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HPS5Q9UPZ3 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HPS5Q9UPZ3 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HPS5Q9UPZ3 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HPS5Q9UPZ3 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HPS5Q9UPZ3 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HPS5Q9UPZ3 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HPS5Q9UPZ3 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HPS5Q9UPZ3 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HPS5Q9UPZ3 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HPS5Q9UPZ3 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HPS5Q9UPZ3 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HPS5Q9UPZ3 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HPS5Q9UPZ3 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HPS5Q9UPZ3 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HPS5Q9UPZ3 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HPS5Q9UPZ3 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HPS5Q9UPZ3 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HPS5Q9UPZ3 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HPS5Q9UPZ3 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HPS5Q9UPZ3 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms