Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKA2

FBXL4, F-box/LRR-repeat protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXL4Q9UKA2 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FBXL4Q9UKA2 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FBXL4Q9UKA2 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FBXL4Q9UKA2 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FBXL4Q9UKA2 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FBXL4Q9UKA2 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FBXL4Q9UKA2 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FBXL4Q9UKA2 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FBXL4Q9UKA2 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FBXL4Q9UKA2 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
FBXL4Q9UKA2 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FBXL4Q9UKA2 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FBXL4Q9UKA2 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FBXL4Q9UKA2 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FBXL4Q9UKA2 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FBXL4Q9UKA2 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FBXL4Q9UKA2 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FBXL4Q9UKA2 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FBXL4Q9UKA2 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FBXL4Q9UKA2 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FBXL4Q9UKA2 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
FBXL4Q9UKA2 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FBXL4Q9UKA2 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FBXL4Q9UKA2 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FBXL4Q9UKA2 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FBXL4Q9UKA2 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FBXL4Q9UKA2 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FBXL4Q9UKA2 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FBXL4Q9UKA2 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FBXL4Q9UKA2 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FBXL4Q9UKA2 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FBXL4Q9UKA2 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FBXL4Q9UKA2 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FBXL4Q9UKA2 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FBXL4Q9UKA2 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FBXL4Q9UKA2 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FBXL4Q9UKA2 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
FBXL4Q9UKA2 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FBXL4Q9UKA2 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FBXL4Q9UKA2 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FBXL4Q9UKA2 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FBXL4Q9UKA2 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FBXL4Q9UKA2 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FBXL4Q9UKA2 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FBXL4Q9UKA2 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FBXL4Q9UKA2 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FBXL4Q9UKA2 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FBXL4Q9UKA2 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FBXL4Q9UKA2 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FBXL4Q9UKA2 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FBXL4Q9UKA2 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FBXL4Q9UKA2 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FBXL4Q9UKA2 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
FBXL4Q9UKA2 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FBXL4Q9UKA2 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FBXL4Q9UKA2 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FBXL4Q9UKA2 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FBXL4Q9UKA2 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FBXL4Q9UKA2 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FBXL4Q9UKA2 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FBXL4Q9UKA2 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FBXL4Q9UKA2 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FBXL4Q9UKA2 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FBXL4Q9UKA2 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FBXL4Q9UKA2 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FBXL4Q9UKA2 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FBXL4Q9UKA2 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FBXL4Q9UKA2 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FBXL4Q9UKA2 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FBXL4Q9UKA2 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FBXL4Q9UKA2 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
FBXL4Q9UKA2 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FBXL4Q9UKA2 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FBXL4Q9UKA2 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FBXL4Q9UKA2 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FBXL4Q9UKA2 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FBXL4Q9UKA2 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FBXL4Q9UKA2 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FBXL4Q9UKA2 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FBXL4Q9UKA2 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FBXL4Q9UKA2 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FBXL4Q9UKA2 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FBXL4Q9UKA2 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FBXL4Q9UKA2 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FBXL4Q9UKA2 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FBXL4Q9UKA2 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
FBXL4Q9UKA2 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
FBXL4Q9UKA2 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
FBXL4Q9UKA2 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
FBXL4Q9UKA2 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
FBXL4Q9UKA2 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
FBXL4Q9UKA2 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FBXL4Q9UKA2 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FBXL4Q9UKA2 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FBXL4Q9UKA2 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FBXL4Q9UKA2 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FBXL4Q9UKA2 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FBXL4Q9UKA2 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FBXL4Q9UKA2 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FBXL4Q9UKA2 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms