Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJW0

DCTN4, Dynactin subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCTN4Q9UJW0 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DCTN4Q9UJW0 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DCTN4Q9UJW0 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
DCTN4Q9UJW0 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DCTN4Q9UJW0 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DCTN4Q9UJW0 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DCTN4Q9UJW0 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DCTN4Q9UJW0 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DCTN4Q9UJW0 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DCTN4Q9UJW0 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DCTN4Q9UJW0 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DCTN4Q9UJW0 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DCTN4Q9UJW0 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DCTN4Q9UJW0 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DCTN4Q9UJW0 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DCTN4Q9UJW0 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DCTN4Q9UJW0 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DCTN4Q9UJW0 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DCTN4Q9UJW0 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DCTN4Q9UJW0 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DCTN4Q9UJW0 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DCTN4Q9UJW0 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DCTN4Q9UJW0 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DCTN4Q9UJW0 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DCTN4Q9UJW0 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DCTN4Q9UJW0 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DCTN4Q9UJW0 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DCTN4Q9UJW0 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DCTN4Q9UJW0 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DCTN4Q9UJW0 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DCTN4Q9UJW0 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DCTN4Q9UJW0 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DCTN4Q9UJW0 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DCTN4Q9UJW0 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DCTN4Q9UJW0 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DCTN4Q9UJW0 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DCTN4Q9UJW0 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DCTN4Q9UJW0 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DCTN4Q9UJW0 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DCTN4Q9UJW0 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DCTN4Q9UJW0 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
DCTN4Q9UJW0 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DCTN4Q9UJW0 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DCTN4Q9UJW0 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DCTN4Q9UJW0 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DCTN4Q9UJW0 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DCTN4Q9UJW0 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DCTN4Q9UJW0 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DCTN4Q9UJW0 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DCTN4Q9UJW0 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DCTN4Q9UJW0 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DCTN4Q9UJW0 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DCTN4Q9UJW0 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DCTN4Q9UJW0 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DCTN4Q9UJW0 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DCTN4Q9UJW0 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DCTN4Q9UJW0 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DCTN4Q9UJW0 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DCTN4Q9UJW0 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DCTN4Q9UJW0 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DCTN4Q9UJW0 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DCTN4Q9UJW0 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DCTN4Q9UJW0 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DCTN4Q9UJW0 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DCTN4Q9UJW0 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DCTN4Q9UJW0 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DCTN4Q9UJW0 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DCTN4Q9UJW0 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
DCTN4Q9UJW0 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
DCTN4Q9UJW0 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DCTN4Q9UJW0 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
DCTN4Q9UJW0 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
DCTN4Q9UJW0 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DCTN4Q9UJW0 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DCTN4Q9UJW0 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DCTN4Q9UJW0 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DCTN4Q9UJW0 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DCTN4Q9UJW0 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DCTN4Q9UJW0 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DCTN4Q9UJW0 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DCTN4Q9UJW0 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DCTN4Q9UJW0 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCTN4Q9UJW0 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCTN4Q9UJW0 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCTN4Q9UJW0 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCTN4Q9UJW0 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCTN4Q9UJW0 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCTN4Q9UJW0 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCTN4Q9UJW0 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCTN4Q9UJW0 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCTN4Q9UJW0 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCTN4Q9UJW0 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCTN4Q9UJW0 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCTN4Q9UJW0 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCTN4Q9UJW0 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCTN4Q9UJW0 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCTN4Q9UJW0 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
DCTN4Q9UJW0 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCTN4Q9UJW0 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
DCTN4Q9UJW0 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms