Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJV3

MID2, Probable E3 ubiquitin-protein ligase MID2, humanhuman

Predictions only

Length 735 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MID2Q9UJV3 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MID2Q9UJV3 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MID2Q9UJV3 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MID2Q9UJV3 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MID2Q9UJV3 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MID2Q9UJV3 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MID2Q9UJV3 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MID2Q9UJV3 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MID2Q9UJV3 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MID2Q9UJV3 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MID2Q9UJV3 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
MID2Q9UJV3 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MID2Q9UJV3 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MID2Q9UJV3 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
MID2Q9UJV3 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MID2Q9UJV3 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MID2Q9UJV3 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
MID2Q9UJV3 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MID2Q9UJV3 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MID2Q9UJV3 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MID2Q9UJV3 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MID2Q9UJV3 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
MID2Q9UJV3 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
MID2Q9UJV3 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MID2Q9UJV3 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
MID2Q9UJV3 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MID2Q9UJV3 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MID2Q9UJV3 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MID2Q9UJV3 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MID2Q9UJV3 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MID2Q9UJV3 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MID2Q9UJV3 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MID2Q9UJV3 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MID2Q9UJV3 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MID2Q9UJV3 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MID2Q9UJV3 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MID2Q9UJV3 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MID2Q9UJV3 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MID2Q9UJV3 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MID2Q9UJV3 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
MID2Q9UJV3 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MID2Q9UJV3 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
MID2Q9UJV3 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MID2Q9UJV3 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
MID2Q9UJV3 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MID2Q9UJV3 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MID2Q9UJV3 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MID2Q9UJV3 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MID2Q9UJV3 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MID2Q9UJV3 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MID2Q9UJV3 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MID2Q9UJV3 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MID2Q9UJV3 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MID2Q9UJV3 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MID2Q9UJV3 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MID2Q9UJV3 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MID2Q9UJV3 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MID2Q9UJV3 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MID2Q9UJV3 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MID2Q9UJV3 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MID2Q9UJV3 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MID2Q9UJV3 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MID2Q9UJV3 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MID2Q9UJV3 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MID2Q9UJV3 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MID2Q9UJV3 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MID2Q9UJV3 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MID2Q9UJV3 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MID2Q9UJV3 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MID2Q9UJV3 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MID2Q9UJV3 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC18■□□□□ 0.47
MID2Q9UJV3 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MID2Q9UJV3 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MID2Q9UJV3 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MID2Q9UJV3 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MID2Q9UJV3 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MID2Q9UJV3 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MID2Q9UJV3 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MID2Q9UJV3 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MID2Q9UJV3 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MID2Q9UJV3 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
MID2Q9UJV3 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MID2Q9UJV3 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MID2Q9UJV3 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MID2Q9UJV3 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MID2Q9UJV3 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
MID2Q9UJV3 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MID2Q9UJV3 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MID2Q9UJV3 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MID2Q9UJV3 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MID2Q9UJV3 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MID2Q9UJV3 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MID2Q9UJV3 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MID2Q9UJV3 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MID2Q9UJV3 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MID2Q9UJV3 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MID2Q9UJV3 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MID2Q9UJV3 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MID2Q9UJV3 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MID2Q9UJV3 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms