Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJK0

TSR3, Ribosome biogenesis protein TSR3 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR3Q9UJK0 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TSR3Q9UJK0 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TSR3Q9UJK0 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TSR3Q9UJK0 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TSR3Q9UJK0 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TSR3Q9UJK0 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TSR3Q9UJK0 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TSR3Q9UJK0 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TSR3Q9UJK0 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TSR3Q9UJK0 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TSR3Q9UJK0 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TSR3Q9UJK0 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TSR3Q9UJK0 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TSR3Q9UJK0 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TSR3Q9UJK0 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TSR3Q9UJK0 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TSR3Q9UJK0 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TSR3Q9UJK0 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TSR3Q9UJK0 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TSR3Q9UJK0 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TSR3Q9UJK0 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TSR3Q9UJK0 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TSR3Q9UJK0 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TSR3Q9UJK0 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TSR3Q9UJK0 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TSR3Q9UJK0 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TSR3Q9UJK0 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TSR3Q9UJK0 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TSR3Q9UJK0 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TSR3Q9UJK0 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TSR3Q9UJK0 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TSR3Q9UJK0 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TSR3Q9UJK0 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TSR3Q9UJK0 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TSR3Q9UJK0 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TSR3Q9UJK0 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TSR3Q9UJK0 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TSR3Q9UJK0 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TSR3Q9UJK0 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TSR3Q9UJK0 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TSR3Q9UJK0 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TSR3Q9UJK0 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TSR3Q9UJK0 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TSR3Q9UJK0 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TSR3Q9UJK0 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TSR3Q9UJK0 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TSR3Q9UJK0 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TSR3Q9UJK0 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TSR3Q9UJK0 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
TSR3Q9UJK0 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TSR3Q9UJK0 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TSR3Q9UJK0 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TSR3Q9UJK0 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TSR3Q9UJK0 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TSR3Q9UJK0 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TSR3Q9UJK0 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TSR3Q9UJK0 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TSR3Q9UJK0 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TSR3Q9UJK0 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TSR3Q9UJK0 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TSR3Q9UJK0 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TSR3Q9UJK0 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TSR3Q9UJK0 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TSR3Q9UJK0 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TSR3Q9UJK0 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TSR3Q9UJK0 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TSR3Q9UJK0 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TSR3Q9UJK0 AC009446.1-201ENST00000519840 808 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TSR3Q9UJK0 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TSR3Q9UJK0 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TSR3Q9UJK0 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TSR3Q9UJK0 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TSR3Q9UJK0 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TSR3Q9UJK0 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TSR3Q9UJK0 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TSR3Q9UJK0 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TSR3Q9UJK0 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TSR3Q9UJK0 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TSR3Q9UJK0 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TSR3Q9UJK0 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TSR3Q9UJK0 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TSR3Q9UJK0 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TSR3Q9UJK0 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TSR3Q9UJK0 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TSR3Q9UJK0 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TSR3Q9UJK0 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TSR3Q9UJK0 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TSR3Q9UJK0 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TSR3Q9UJK0 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TSR3Q9UJK0 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TSR3Q9UJK0 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TSR3Q9UJK0 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TSR3Q9UJK0 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TSR3Q9UJK0 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TSR3Q9UJK0 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TSR3Q9UJK0 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TSR3Q9UJK0 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TSR3Q9UJK0 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TSR3Q9UJK0 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TSR3Q9UJK0 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms