Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIS9

MBD1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD1Q9UIS9 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MBD1Q9UIS9 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MBD1Q9UIS9 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MBD1Q9UIS9 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MBD1Q9UIS9 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MBD1Q9UIS9 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MBD1Q9UIS9 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MBD1Q9UIS9 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MBD1Q9UIS9 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MBD1Q9UIS9 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
MBD1Q9UIS9 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
MBD1Q9UIS9 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MBD1Q9UIS9 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MBD1Q9UIS9 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
MBD1Q9UIS9 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MBD1Q9UIS9 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MBD1Q9UIS9 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MBD1Q9UIS9 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MBD1Q9UIS9 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
MBD1Q9UIS9 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
MBD1Q9UIS9 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
MBD1Q9UIS9 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
MBD1Q9UIS9 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
MBD1Q9UIS9 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MBD1Q9UIS9 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MBD1Q9UIS9 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MBD1Q9UIS9 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MBD1Q9UIS9 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MBD1Q9UIS9 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MBD1Q9UIS9 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MBD1Q9UIS9 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MBD1Q9UIS9 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MBD1Q9UIS9 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MBD1Q9UIS9 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MBD1Q9UIS9 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MBD1Q9UIS9 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
MBD1Q9UIS9 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MBD1Q9UIS9 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MBD1Q9UIS9 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MBD1Q9UIS9 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MBD1Q9UIS9 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
MBD1Q9UIS9 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MBD1Q9UIS9 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MBD1Q9UIS9 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MBD1Q9UIS9 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MBD1Q9UIS9 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MBD1Q9UIS9 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MBD1Q9UIS9 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
MBD1Q9UIS9 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MBD1Q9UIS9 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MBD1Q9UIS9 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MBD1Q9UIS9 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MBD1Q9UIS9 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MBD1Q9UIS9 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MBD1Q9UIS9 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MBD1Q9UIS9 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MBD1Q9UIS9 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MBD1Q9UIS9 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MBD1Q9UIS9 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MBD1Q9UIS9 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MBD1Q9UIS9 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MBD1Q9UIS9 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MBD1Q9UIS9 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MBD1Q9UIS9 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MBD1Q9UIS9 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MBD1Q9UIS9 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MBD1Q9UIS9 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MBD1Q9UIS9 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MBD1Q9UIS9 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MBD1Q9UIS9 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
MBD1Q9UIS9 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MBD1Q9UIS9 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MBD1Q9UIS9 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MBD1Q9UIS9 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MBD1Q9UIS9 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MBD1Q9UIS9 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MBD1Q9UIS9 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MBD1Q9UIS9 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MBD1Q9UIS9 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MBD1Q9UIS9 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MBD1Q9UIS9 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
MBD1Q9UIS9 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MBD1Q9UIS9 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MBD1Q9UIS9 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MBD1Q9UIS9 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MBD1Q9UIS9 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MBD1Q9UIS9 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MBD1Q9UIS9 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MBD1Q9UIS9 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MBD1Q9UIS9 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MBD1Q9UIS9 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MBD1Q9UIS9 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
MBD1Q9UIS9 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
MBD1Q9UIS9 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MBD1Q9UIS9 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MBD1Q9UIS9 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MBD1Q9UIS9 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MBD1Q9UIS9 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
MBD1Q9UIS9 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MBD1Q9UIS9 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms