Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,018 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP35Q9P2H5 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP35Q9P2H5 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP35Q9P2H5 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP35Q9P2H5 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP35Q9P2H5 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP35Q9P2H5 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP35Q9P2H5 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP35Q9P2H5 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP35Q9P2H5 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP35Q9P2H5 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP35Q9P2H5 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP35Q9P2H5 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP35Q9P2H5 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP35Q9P2H5 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP35Q9P2H5 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP35Q9P2H5 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP35Q9P2H5 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP35Q9P2H5 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP35Q9P2H5 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP35Q9P2H5 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP35Q9P2H5 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP35Q9P2H5 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP35Q9P2H5 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP35Q9P2H5 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP35Q9P2H5 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP35Q9P2H5 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP35Q9P2H5 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP35Q9P2H5 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP35Q9P2H5 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP35Q9P2H5 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP35Q9P2H5 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP35Q9P2H5 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP35Q9P2H5 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP35Q9P2H5 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP35Q9P2H5 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP35Q9P2H5 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP35Q9P2H5 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP35Q9P2H5 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
USP35Q9P2H5 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP35Q9P2H5 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
USP35Q9P2H5 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP35Q9P2H5 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP35Q9P2H5 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP35Q9P2H5 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP35Q9P2H5 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP35Q9P2H5 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP35Q9P2H5 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP35Q9P2H5 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP35Q9P2H5 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP35Q9P2H5 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP35Q9P2H5 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
USP35Q9P2H5 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP35Q9P2H5 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
USP35Q9P2H5 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP35Q9P2H5 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP35Q9P2H5 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP35Q9P2H5 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP35Q9P2H5 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP35Q9P2H5 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
USP35Q9P2H5 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP35Q9P2H5 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP35Q9P2H5 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP35Q9P2H5 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP35Q9P2H5 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP35Q9P2H5 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP35Q9P2H5 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP35Q9P2H5 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP35Q9P2H5 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP35Q9P2H5 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP35Q9P2H5 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
USP35Q9P2H5 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
USP35Q9P2H5 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
USP35Q9P2H5 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP35Q9P2H5 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP35Q9P2H5 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP35Q9P2H5 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP35Q9P2H5 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP35Q9P2H5 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP35Q9P2H5 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP35Q9P2H5 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP35Q9P2H5 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP35Q9P2H5 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP35Q9P2H5 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP35Q9P2H5 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP35Q9P2H5 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP35Q9P2H5 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP35Q9P2H5 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
USP35Q9P2H5 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP35Q9P2H5 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP35Q9P2H5 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP35Q9P2H5 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP35Q9P2H5 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP35Q9P2H5 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP35Q9P2H5 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP35Q9P2H5 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP35Q9P2H5 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP35Q9P2H5 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
USP35Q9P2H5 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP35Q9P2H5 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms