Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms