Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
GDE1Q9NZC3 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GDE1Q9NZC3 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GDE1Q9NZC3 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GDE1Q9NZC3 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
GDE1Q9NZC3 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
GDE1Q9NZC3 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GDE1Q9NZC3 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GDE1Q9NZC3 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GDE1Q9NZC3 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
GDE1Q9NZC3 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GDE1Q9NZC3 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
GDE1Q9NZC3 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
GDE1Q9NZC3 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GDE1Q9NZC3 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GDE1Q9NZC3 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GDE1Q9NZC3 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GDE1Q9NZC3 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GDE1Q9NZC3 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GDE1Q9NZC3 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GDE1Q9NZC3 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GDE1Q9NZC3 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GDE1Q9NZC3 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GDE1Q9NZC3 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GDE1Q9NZC3 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GDE1Q9NZC3 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
GDE1Q9NZC3 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GDE1Q9NZC3 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GDE1Q9NZC3 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GDE1Q9NZC3 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GDE1Q9NZC3 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GDE1Q9NZC3 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GDE1Q9NZC3 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GDE1Q9NZC3 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GDE1Q9NZC3 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
GDE1Q9NZC3 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
GDE1Q9NZC3 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
GDE1Q9NZC3 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GDE1Q9NZC3 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GDE1Q9NZC3 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
GDE1Q9NZC3 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GDE1Q9NZC3 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GDE1Q9NZC3 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GDE1Q9NZC3 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GDE1Q9NZC3 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GDE1Q9NZC3 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GDE1Q9NZC3 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GDE1Q9NZC3 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GDE1Q9NZC3 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GDE1Q9NZC3 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GDE1Q9NZC3 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GDE1Q9NZC3 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GDE1Q9NZC3 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GDE1Q9NZC3 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GDE1Q9NZC3 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GDE1Q9NZC3 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GDE1Q9NZC3 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GDE1Q9NZC3 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GDE1Q9NZC3 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
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GDE1Q9NZC3 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GDE1Q9NZC3 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GDE1Q9NZC3 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GDE1Q9NZC3 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GDE1Q9NZC3 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
GDE1Q9NZC3 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GDE1Q9NZC3 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
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GDE1Q9NZC3 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GDE1Q9NZC3 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GDE1Q9NZC3 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GDE1Q9NZC3 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GDE1Q9NZC3 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GDE1Q9NZC3 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GDE1Q9NZC3 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GDE1Q9NZC3 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GDE1Q9NZC3 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GDE1Q9NZC3 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GDE1Q9NZC3 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GDE1Q9NZC3 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GDE1Q9NZC3 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GDE1Q9NZC3 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
GDE1Q9NZC3 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GDE1Q9NZC3 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GDE1Q9NZC3 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GDE1Q9NZC3 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GDE1Q9NZC3 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GDE1Q9NZC3 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GDE1Q9NZC3 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GDE1Q9NZC3 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
GDE1Q9NZC3 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GDE1Q9NZC3 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GDE1Q9NZC3 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GDE1Q9NZC3 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GDE1Q9NZC3 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GDE1Q9NZC3 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GDE1Q9NZC3 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GDE1Q9NZC3 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GDE1Q9NZC3 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GDE1Q9NZC3 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
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