Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW38

FANCL, E3 ubiquitin-protein ligase FANCL, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCLQ9NW38 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FANCLQ9NW38 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FANCLQ9NW38 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FANCLQ9NW38 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FANCLQ9NW38 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FANCLQ9NW38 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FANCLQ9NW38 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FANCLQ9NW38 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FANCLQ9NW38 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FANCLQ9NW38 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FANCLQ9NW38 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FANCLQ9NW38 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FANCLQ9NW38 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FANCLQ9NW38 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
FANCLQ9NW38 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
FANCLQ9NW38 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
FANCLQ9NW38 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FANCLQ9NW38 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FANCLQ9NW38 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FANCLQ9NW38 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
FANCLQ9NW38 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FANCLQ9NW38 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FANCLQ9NW38 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FANCLQ9NW38 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FANCLQ9NW38 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FANCLQ9NW38 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FANCLQ9NW38 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FANCLQ9NW38 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FANCLQ9NW38 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
FANCLQ9NW38 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FANCLQ9NW38 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FANCLQ9NW38 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FANCLQ9NW38 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FANCLQ9NW38 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FANCLQ9NW38 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FANCLQ9NW38 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FANCLQ9NW38 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FANCLQ9NW38 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FANCLQ9NW38 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FANCLQ9NW38 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FANCLQ9NW38 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FANCLQ9NW38 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FANCLQ9NW38 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
FANCLQ9NW38 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FANCLQ9NW38 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FANCLQ9NW38 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FANCLQ9NW38 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FANCLQ9NW38 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FANCLQ9NW38 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FANCLQ9NW38 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FANCLQ9NW38 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FANCLQ9NW38 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FANCLQ9NW38 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FANCLQ9NW38 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FANCLQ9NW38 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
FANCLQ9NW38 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FANCLQ9NW38 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FANCLQ9NW38 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FANCLQ9NW38 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FANCLQ9NW38 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FANCLQ9NW38 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FANCLQ9NW38 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FANCLQ9NW38 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FANCLQ9NW38 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FANCLQ9NW38 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FANCLQ9NW38 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FANCLQ9NW38 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FANCLQ9NW38 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FANCLQ9NW38 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FANCLQ9NW38 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FANCLQ9NW38 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FANCLQ9NW38 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FANCLQ9NW38 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FANCLQ9NW38 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FANCLQ9NW38 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FANCLQ9NW38 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FANCLQ9NW38 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FANCLQ9NW38 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
FANCLQ9NW38 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FANCLQ9NW38 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FANCLQ9NW38 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FANCLQ9NW38 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
FANCLQ9NW38 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FANCLQ9NW38 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FANCLQ9NW38 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FANCLQ9NW38 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FANCLQ9NW38 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FANCLQ9NW38 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
FANCLQ9NW38 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FANCLQ9NW38 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FANCLQ9NW38 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FANCLQ9NW38 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FANCLQ9NW38 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FANCLQ9NW38 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FANCLQ9NW38 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FANCLQ9NW38 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FANCLQ9NW38 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FANCLQ9NW38 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FANCLQ9NW38 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FANCLQ9NW38 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.9 ms