Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVP2

ASF1B, Histone chaperone ASF1B, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASF1BQ9NVP2 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ASF1BQ9NVP2 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ASF1BQ9NVP2 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ASF1BQ9NVP2 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ASF1BQ9NVP2 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ASF1BQ9NVP2 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ASF1BQ9NVP2 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ASF1BQ9NVP2 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ASF1BQ9NVP2 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ASF1BQ9NVP2 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ASF1BQ9NVP2 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ASF1BQ9NVP2 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ASF1BQ9NVP2 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ASF1BQ9NVP2 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ASF1BQ9NVP2 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ASF1BQ9NVP2 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ASF1BQ9NVP2 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ASF1BQ9NVP2 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ASF1BQ9NVP2 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ASF1BQ9NVP2 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ASF1BQ9NVP2 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ASF1BQ9NVP2 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ASF1BQ9NVP2 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ASF1BQ9NVP2 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ASF1BQ9NVP2 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ASF1BQ9NVP2 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ASF1BQ9NVP2 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ASF1BQ9NVP2 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ASF1BQ9NVP2 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ASF1BQ9NVP2 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ASF1BQ9NVP2 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ASF1BQ9NVP2 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ASF1BQ9NVP2 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ASF1BQ9NVP2 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ASF1BQ9NVP2 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ASF1BQ9NVP2 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ASF1BQ9NVP2 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ASF1BQ9NVP2 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ASF1BQ9NVP2 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ASF1BQ9NVP2 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ASF1BQ9NVP2 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ASF1BQ9NVP2 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ASF1BQ9NVP2 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ASF1BQ9NVP2 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ASF1BQ9NVP2 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ASF1BQ9NVP2 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ASF1BQ9NVP2 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ASF1BQ9NVP2 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ASF1BQ9NVP2 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ASF1BQ9NVP2 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ASF1BQ9NVP2 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ASF1BQ9NVP2 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ASF1BQ9NVP2 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ASF1BQ9NVP2 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ASF1BQ9NVP2 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ASF1BQ9NVP2 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ASF1BQ9NVP2 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ASF1BQ9NVP2 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ASF1BQ9NVP2 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ASF1BQ9NVP2 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ASF1BQ9NVP2 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ASF1BQ9NVP2 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ASF1BQ9NVP2 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ASF1BQ9NVP2 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ASF1BQ9NVP2 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ASF1BQ9NVP2 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ASF1BQ9NVP2 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ASF1BQ9NVP2 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ASF1BQ9NVP2 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
ASF1BQ9NVP2 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ASF1BQ9NVP2 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ASF1BQ9NVP2 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ASF1BQ9NVP2 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ASF1BQ9NVP2 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ASF1BQ9NVP2 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ASF1BQ9NVP2 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ASF1BQ9NVP2 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ASF1BQ9NVP2 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ASF1BQ9NVP2 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ASF1BQ9NVP2 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ASF1BQ9NVP2 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ASF1BQ9NVP2 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ASF1BQ9NVP2 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ASF1BQ9NVP2 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ASF1BQ9NVP2 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ASF1BQ9NVP2 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ASF1BQ9NVP2 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ASF1BQ9NVP2 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ASF1BQ9NVP2 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ASF1BQ9NVP2 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ASF1BQ9NVP2 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ASF1BQ9NVP2 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ASF1BQ9NVP2 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ASF1BQ9NVP2 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ASF1BQ9NVP2 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ASF1BQ9NVP2 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ASF1BQ9NVP2 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ASF1BQ9NVP2 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ASF1BQ9NVP2 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ASF1BQ9NVP2 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms