Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN5

LMBRD1, Probable lysosomal cobalamin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD1Q9NUN5 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
LMBRD1Q9NUN5 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LMBRD1Q9NUN5 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LMBRD1Q9NUN5 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LMBRD1Q9NUN5 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LMBRD1Q9NUN5 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LMBRD1Q9NUN5 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LMBRD1Q9NUN5 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LMBRD1Q9NUN5 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LMBRD1Q9NUN5 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LMBRD1Q9NUN5 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LMBRD1Q9NUN5 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LMBRD1Q9NUN5 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LMBRD1Q9NUN5 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
LMBRD1Q9NUN5 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LMBRD1Q9NUN5 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LMBRD1Q9NUN5 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LMBRD1Q9NUN5 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
LMBRD1Q9NUN5 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LMBRD1Q9NUN5 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LMBRD1Q9NUN5 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LMBRD1Q9NUN5 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LMBRD1Q9NUN5 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
LMBRD1Q9NUN5 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
LMBRD1Q9NUN5 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LMBRD1Q9NUN5 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LMBRD1Q9NUN5 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LMBRD1Q9NUN5 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LMBRD1Q9NUN5 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LMBRD1Q9NUN5 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LMBRD1Q9NUN5 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LMBRD1Q9NUN5 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LMBRD1Q9NUN5 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LMBRD1Q9NUN5 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
LMBRD1Q9NUN5 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LMBRD1Q9NUN5 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LMBRD1Q9NUN5 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LMBRD1Q9NUN5 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
LMBRD1Q9NUN5 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LMBRD1Q9NUN5 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LMBRD1Q9NUN5 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LMBRD1Q9NUN5 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LMBRD1Q9NUN5 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LMBRD1Q9NUN5 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LMBRD1Q9NUN5 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LMBRD1Q9NUN5 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LMBRD1Q9NUN5 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LMBRD1Q9NUN5 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LMBRD1Q9NUN5 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LMBRD1Q9NUN5 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LMBRD1Q9NUN5 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LMBRD1Q9NUN5 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LMBRD1Q9NUN5 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LMBRD1Q9NUN5 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LMBRD1Q9NUN5 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LMBRD1Q9NUN5 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LMBRD1Q9NUN5 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LMBRD1Q9NUN5 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LMBRD1Q9NUN5 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LMBRD1Q9NUN5 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LMBRD1Q9NUN5 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LMBRD1Q9NUN5 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
LMBRD1Q9NUN5 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LMBRD1Q9NUN5 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LMBRD1Q9NUN5 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LMBRD1Q9NUN5 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LMBRD1Q9NUN5 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LMBRD1Q9NUN5 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LMBRD1Q9NUN5 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LMBRD1Q9NUN5 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LMBRD1Q9NUN5 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LMBRD1Q9NUN5 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
LMBRD1Q9NUN5 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LMBRD1Q9NUN5 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LMBRD1Q9NUN5 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LMBRD1Q9NUN5 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LMBRD1Q9NUN5 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LMBRD1Q9NUN5 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LMBRD1Q9NUN5 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LMBRD1Q9NUN5 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LMBRD1Q9NUN5 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LMBRD1Q9NUN5 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LMBRD1Q9NUN5 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LMBRD1Q9NUN5 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LMBRD1Q9NUN5 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LMBRD1Q9NUN5 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LMBRD1Q9NUN5 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LMBRD1Q9NUN5 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LMBRD1Q9NUN5 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LMBRD1Q9NUN5 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LMBRD1Q9NUN5 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
LMBRD1Q9NUN5 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LMBRD1Q9NUN5 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LMBRD1Q9NUN5 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LMBRD1Q9NUN5 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LMBRD1Q9NUN5 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LMBRD1Q9NUN5 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LMBRD1Q9NUN5 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LMBRD1Q9NUN5 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LMBRD1Q9NUN5 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms