Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTQ9

GJB4, Gap junction beta-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB4Q9NTQ9 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GJB4Q9NTQ9 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GJB4Q9NTQ9 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GJB4Q9NTQ9 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GJB4Q9NTQ9 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GJB4Q9NTQ9 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GJB4Q9NTQ9 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GJB4Q9NTQ9 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GJB4Q9NTQ9 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GJB4Q9NTQ9 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GJB4Q9NTQ9 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GJB4Q9NTQ9 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GJB4Q9NTQ9 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GJB4Q9NTQ9 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
GJB4Q9NTQ9 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GJB4Q9NTQ9 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GJB4Q9NTQ9 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GJB4Q9NTQ9 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
GJB4Q9NTQ9 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GJB4Q9NTQ9 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GJB4Q9NTQ9 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GJB4Q9NTQ9 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GJB4Q9NTQ9 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GJB4Q9NTQ9 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GJB4Q9NTQ9 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GJB4Q9NTQ9 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GJB4Q9NTQ9 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GJB4Q9NTQ9 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GJB4Q9NTQ9 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GJB4Q9NTQ9 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GJB4Q9NTQ9 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GJB4Q9NTQ9 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GJB4Q9NTQ9 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GJB4Q9NTQ9 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GJB4Q9NTQ9 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GJB4Q9NTQ9 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GJB4Q9NTQ9 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GJB4Q9NTQ9 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GJB4Q9NTQ9 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GJB4Q9NTQ9 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
GJB4Q9NTQ9 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GJB4Q9NTQ9 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GJB4Q9NTQ9 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
GJB4Q9NTQ9 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GJB4Q9NTQ9 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
GJB4Q9NTQ9 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GJB4Q9NTQ9 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GJB4Q9NTQ9 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GJB4Q9NTQ9 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GJB4Q9NTQ9 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GJB4Q9NTQ9 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GJB4Q9NTQ9 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GJB4Q9NTQ9 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
GJB4Q9NTQ9 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GJB4Q9NTQ9 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GJB4Q9NTQ9 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GJB4Q9NTQ9 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GJB4Q9NTQ9 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GJB4Q9NTQ9 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GJB4Q9NTQ9 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GJB4Q9NTQ9 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GJB4Q9NTQ9 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GJB4Q9NTQ9 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GJB4Q9NTQ9 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GJB4Q9NTQ9 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GJB4Q9NTQ9 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
GJB4Q9NTQ9 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GJB4Q9NTQ9 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
GJB4Q9NTQ9 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GJB4Q9NTQ9 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GJB4Q9NTQ9 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GJB4Q9NTQ9 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GJB4Q9NTQ9 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GJB4Q9NTQ9 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
GJB4Q9NTQ9 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GJB4Q9NTQ9 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GJB4Q9NTQ9 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GJB4Q9NTQ9 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GJB4Q9NTQ9 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GJB4Q9NTQ9 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GJB4Q9NTQ9 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
GJB4Q9NTQ9 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GJB4Q9NTQ9 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GJB4Q9NTQ9 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GJB4Q9NTQ9 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GJB4Q9NTQ9 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GJB4Q9NTQ9 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GJB4Q9NTQ9 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GJB4Q9NTQ9 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GJB4Q9NTQ9 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GJB4Q9NTQ9 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
GJB4Q9NTQ9 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GJB4Q9NTQ9 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GJB4Q9NTQ9 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GJB4Q9NTQ9 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GJB4Q9NTQ9 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GJB4Q9NTQ9 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
GJB4Q9NTQ9 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
GJB4Q9NTQ9 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
GJB4Q9NTQ9 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms