Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSQ0

RRP7BP, Putative ribosomal RNA-processing protein 7 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP7BPQ9NSQ0 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RRP7BPQ9NSQ0 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RRP7BPQ9NSQ0 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RRP7BPQ9NSQ0 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RRP7BPQ9NSQ0 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RRP7BPQ9NSQ0 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RRP7BPQ9NSQ0 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
RRP7BPQ9NSQ0 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RRP7BPQ9NSQ0 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RRP7BPQ9NSQ0 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
RRP7BPQ9NSQ0 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
RRP7BPQ9NSQ0 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RRP7BPQ9NSQ0 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RRP7BPQ9NSQ0 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RRP7BPQ9NSQ0 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RRP7BPQ9NSQ0 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RRP7BPQ9NSQ0 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RRP7BPQ9NSQ0 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RRP7BPQ9NSQ0 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RRP7BPQ9NSQ0 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RRP7BPQ9NSQ0 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RRP7BPQ9NSQ0 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RRP7BPQ9NSQ0 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RRP7BPQ9NSQ0 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RRP7BPQ9NSQ0 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RRP7BPQ9NSQ0 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RRP7BPQ9NSQ0 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RRP7BPQ9NSQ0 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RRP7BPQ9NSQ0 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RRP7BPQ9NSQ0 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RRP7BPQ9NSQ0 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
RRP7BPQ9NSQ0 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RRP7BPQ9NSQ0 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RRP7BPQ9NSQ0 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RRP7BPQ9NSQ0 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RRP7BPQ9NSQ0 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RRP7BPQ9NSQ0 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RRP7BPQ9NSQ0 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RRP7BPQ9NSQ0 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RRP7BPQ9NSQ0 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
RRP7BPQ9NSQ0 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RRP7BPQ9NSQ0 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RRP7BPQ9NSQ0 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RRP7BPQ9NSQ0 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
RRP7BPQ9NSQ0 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RRP7BPQ9NSQ0 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RRP7BPQ9NSQ0 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RRP7BPQ9NSQ0 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RRP7BPQ9NSQ0 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RRP7BPQ9NSQ0 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RRP7BPQ9NSQ0 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RRP7BPQ9NSQ0 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RRP7BPQ9NSQ0 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RRP7BPQ9NSQ0 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RRP7BPQ9NSQ0 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RRP7BPQ9NSQ0 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RRP7BPQ9NSQ0 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RRP7BPQ9NSQ0 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RRP7BPQ9NSQ0 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RRP7BPQ9NSQ0 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RRP7BPQ9NSQ0 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
RRP7BPQ9NSQ0 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RRP7BPQ9NSQ0 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
RRP7BPQ9NSQ0 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RRP7BPQ9NSQ0 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
RRP7BPQ9NSQ0 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RRP7BPQ9NSQ0 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RRP7BPQ9NSQ0 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RRP7BPQ9NSQ0 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
RRP7BPQ9NSQ0 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RRP7BPQ9NSQ0 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RRP7BPQ9NSQ0 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RRP7BPQ9NSQ0 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RRP7BPQ9NSQ0 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
RRP7BPQ9NSQ0 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RRP7BPQ9NSQ0 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RRP7BPQ9NSQ0 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RRP7BPQ9NSQ0 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RRP7BPQ9NSQ0 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RRP7BPQ9NSQ0 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RRP7BPQ9NSQ0 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RRP7BPQ9NSQ0 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RRP7BPQ9NSQ0 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RRP7BPQ9NSQ0 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RRP7BPQ9NSQ0 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RRP7BPQ9NSQ0 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RRP7BPQ9NSQ0 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RRP7BPQ9NSQ0 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RRP7BPQ9NSQ0 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
RRP7BPQ9NSQ0 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
RRP7BPQ9NSQ0 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
RRP7BPQ9NSQ0 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RRP7BPQ9NSQ0 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RRP7BPQ9NSQ0 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RRP7BPQ9NSQ0 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RRP7BPQ9NSQ0 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RRP7BPQ9NSQ0 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RRP7BPQ9NSQ0 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
RRP7BPQ9NSQ0 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RRP7BPQ9NSQ0 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms