Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSP4

CENPM, Centromere protein M, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPMQ9NSP4 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPMQ9NSP4 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPMQ9NSP4 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPMQ9NSP4 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPMQ9NSP4 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPMQ9NSP4 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPMQ9NSP4 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPMQ9NSP4 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPMQ9NSP4 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPMQ9NSP4 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPMQ9NSP4 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPMQ9NSP4 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPMQ9NSP4 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPMQ9NSP4 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPMQ9NSP4 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPMQ9NSP4 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPMQ9NSP4 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPMQ9NSP4 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPMQ9NSP4 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPMQ9NSP4 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPMQ9NSP4 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPMQ9NSP4 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPMQ9NSP4 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPMQ9NSP4 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPMQ9NSP4 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CENPMQ9NSP4 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CENPMQ9NSP4 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CENPMQ9NSP4 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CENPMQ9NSP4 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CENPMQ9NSP4 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CENPMQ9NSP4 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CENPMQ9NSP4 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CENPMQ9NSP4 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CENPMQ9NSP4 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CENPMQ9NSP4 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CENPMQ9NSP4 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CENPMQ9NSP4 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CENPMQ9NSP4 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CENPMQ9NSP4 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CENPMQ9NSP4 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CENPMQ9NSP4 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CENPMQ9NSP4 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CENPMQ9NSP4 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CENPMQ9NSP4 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CENPMQ9NSP4 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CENPMQ9NSP4 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CENPMQ9NSP4 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CENPMQ9NSP4 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CENPMQ9NSP4 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CENPMQ9NSP4 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CENPMQ9NSP4 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CENPMQ9NSP4 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CENPMQ9NSP4 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CENPMQ9NSP4 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CENPMQ9NSP4 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CENPMQ9NSP4 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CENPMQ9NSP4 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CENPMQ9NSP4 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CENPMQ9NSP4 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CENPMQ9NSP4 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CENPMQ9NSP4 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms