Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7E2

TDRD3, Tudor domain-containing protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 651 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD3Q9H7E2 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TDRD3Q9H7E2 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TDRD3Q9H7E2 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TDRD3Q9H7E2 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TDRD3Q9H7E2 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TDRD3Q9H7E2 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TDRD3Q9H7E2 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TDRD3Q9H7E2 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TDRD3Q9H7E2 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TDRD3Q9H7E2 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TDRD3Q9H7E2 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TDRD3Q9H7E2 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TDRD3Q9H7E2 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TDRD3Q9H7E2 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TDRD3Q9H7E2 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TDRD3Q9H7E2 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TDRD3Q9H7E2 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TDRD3Q9H7E2 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TDRD3Q9H7E2 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TDRD3Q9H7E2 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TDRD3Q9H7E2 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TDRD3Q9H7E2 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TDRD3Q9H7E2 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TDRD3Q9H7E2 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TDRD3Q9H7E2 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TDRD3Q9H7E2 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TDRD3Q9H7E2 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TDRD3Q9H7E2 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TDRD3Q9H7E2 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TDRD3Q9H7E2 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TDRD3Q9H7E2 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TDRD3Q9H7E2 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TDRD3Q9H7E2 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TDRD3Q9H7E2 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TDRD3Q9H7E2 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TDRD3Q9H7E2 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TDRD3Q9H7E2 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TDRD3Q9H7E2 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TDRD3Q9H7E2 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TDRD3Q9H7E2 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TDRD3Q9H7E2 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TDRD3Q9H7E2 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TDRD3Q9H7E2 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TDRD3Q9H7E2 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TDRD3Q9H7E2 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TDRD3Q9H7E2 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TDRD3Q9H7E2 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TDRD3Q9H7E2 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TDRD3Q9H7E2 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TDRD3Q9H7E2 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TDRD3Q9H7E2 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TDRD3Q9H7E2 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TDRD3Q9H7E2 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TDRD3Q9H7E2 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TDRD3Q9H7E2 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TDRD3Q9H7E2 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TDRD3Q9H7E2 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TDRD3Q9H7E2 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TDRD3Q9H7E2 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TDRD3Q9H7E2 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TDRD3Q9H7E2 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TDRD3Q9H7E2 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TDRD3Q9H7E2 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TDRD3Q9H7E2 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TDRD3Q9H7E2 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TDRD3Q9H7E2 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TDRD3Q9H7E2 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TDRD3Q9H7E2 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TDRD3Q9H7E2 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TDRD3Q9H7E2 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TDRD3Q9H7E2 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TDRD3Q9H7E2 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TDRD3Q9H7E2 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TDRD3Q9H7E2 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
TDRD3Q9H7E2 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
TDRD3Q9H7E2 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
TDRD3Q9H7E2 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
TDRD3Q9H7E2 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TDRD3Q9H7E2 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TDRD3Q9H7E2 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TDRD3Q9H7E2 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TDRD3Q9H7E2 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TDRD3Q9H7E2 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TDRD3Q9H7E2 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TDRD3Q9H7E2 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TDRD3Q9H7E2 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TDRD3Q9H7E2 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TDRD3Q9H7E2 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TDRD3Q9H7E2 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TDRD3Q9H7E2 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TDRD3Q9H7E2 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TDRD3Q9H7E2 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TDRD3Q9H7E2 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TDRD3Q9H7E2 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TDRD3Q9H7E2 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TDRD3Q9H7E2 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TDRD3Q9H7E2 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TDRD3Q9H7E2 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TDRD3Q9H7E2 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TDRD3Q9H7E2 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms