Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2E6

SEMA6A, Semaphorin-6A, humanhuman

Predictions only

Length 1,030 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6AQ9H2E6 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SEMA6AQ9H2E6 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEMA6AQ9H2E6 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEMA6AQ9H2E6 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEMA6AQ9H2E6 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEMA6AQ9H2E6 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEMA6AQ9H2E6 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEMA6AQ9H2E6 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEMA6AQ9H2E6 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEMA6AQ9H2E6 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA6AQ9H2E6 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA6AQ9H2E6 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA6AQ9H2E6 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA6AQ9H2E6 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA6AQ9H2E6 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA6AQ9H2E6 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA6AQ9H2E6 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA6AQ9H2E6 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA6AQ9H2E6 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA6AQ9H2E6 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA6AQ9H2E6 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA6AQ9H2E6 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA6AQ9H2E6 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA6AQ9H2E6 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA6AQ9H2E6 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA6AQ9H2E6 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA6AQ9H2E6 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA6AQ9H2E6 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA6AQ9H2E6 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA6AQ9H2E6 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA6AQ9H2E6 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA6AQ9H2E6 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA6AQ9H2E6 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA6AQ9H2E6 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA6AQ9H2E6 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA6AQ9H2E6 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA6AQ9H2E6 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA6AQ9H2E6 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA6AQ9H2E6 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA6AQ9H2E6 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA6AQ9H2E6 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA6AQ9H2E6 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA6AQ9H2E6 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA6AQ9H2E6 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA6AQ9H2E6 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA6AQ9H2E6 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA6AQ9H2E6 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA6AQ9H2E6 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA6AQ9H2E6 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA6AQ9H2E6 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA6AQ9H2E6 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEMA6AQ9H2E6 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEMA6AQ9H2E6 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEMA6AQ9H2E6 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEMA6AQ9H2E6 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEMA6AQ9H2E6 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEMA6AQ9H2E6 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEMA6AQ9H2E6 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEMA6AQ9H2E6 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEMA6AQ9H2E6 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEMA6AQ9H2E6 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEMA6AQ9H2E6 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEMA6AQ9H2E6 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEMA6AQ9H2E6 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEMA6AQ9H2E6 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEMA6AQ9H2E6 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEMA6AQ9H2E6 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SEMA6AQ9H2E6 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEMA6AQ9H2E6 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEMA6AQ9H2E6 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEMA6AQ9H2E6 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEMA6AQ9H2E6 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEMA6AQ9H2E6 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEMA6AQ9H2E6 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEMA6AQ9H2E6 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEMA6AQ9H2E6 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEMA6AQ9H2E6 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEMA6AQ9H2E6 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEMA6AQ9H2E6 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEMA6AQ9H2E6 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEMA6AQ9H2E6 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEMA6AQ9H2E6 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SEMA6AQ9H2E6 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEMA6AQ9H2E6 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEMA6AQ9H2E6 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEMA6AQ9H2E6 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEMA6AQ9H2E6 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEMA6AQ9H2E6 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEMA6AQ9H2E6 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEMA6AQ9H2E6 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEMA6AQ9H2E6 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEMA6AQ9H2E6 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEMA6AQ9H2E6 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEMA6AQ9H2E6 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEMA6AQ9H2E6 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEMA6AQ9H2E6 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEMA6AQ9H2E6 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEMA6AQ9H2E6 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEMA6AQ9H2E6 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEMA6AQ9H2E6 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms