Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0F6

SHARPIN, Sharpin, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHARPINQ9H0F6 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SHARPINQ9H0F6 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SHARPINQ9H0F6 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SHARPINQ9H0F6 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SHARPINQ9H0F6 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SHARPINQ9H0F6 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SHARPINQ9H0F6 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SHARPINQ9H0F6 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SHARPINQ9H0F6 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SHARPINQ9H0F6 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SHARPINQ9H0F6 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SHARPINQ9H0F6 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SHARPINQ9H0F6 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SHARPINQ9H0F6 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SHARPINQ9H0F6 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SHARPINQ9H0F6 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SHARPINQ9H0F6 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SHARPINQ9H0F6 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SHARPINQ9H0F6 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SHARPINQ9H0F6 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SHARPINQ9H0F6 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SHARPINQ9H0F6 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SHARPINQ9H0F6 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SHARPINQ9H0F6 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SHARPINQ9H0F6 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SHARPINQ9H0F6 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SHARPINQ9H0F6 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SHARPINQ9H0F6 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SHARPINQ9H0F6 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SHARPINQ9H0F6 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SHARPINQ9H0F6 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SHARPINQ9H0F6 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SHARPINQ9H0F6 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SHARPINQ9H0F6 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SHARPINQ9H0F6 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SHARPINQ9H0F6 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SHARPINQ9H0F6 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SHARPINQ9H0F6 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SHARPINQ9H0F6 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SHARPINQ9H0F6 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SHARPINQ9H0F6 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SHARPINQ9H0F6 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SHARPINQ9H0F6 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SHARPINQ9H0F6 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SHARPINQ9H0F6 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SHARPINQ9H0F6 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SHARPINQ9H0F6 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SHARPINQ9H0F6 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SHARPINQ9H0F6 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SHARPINQ9H0F6 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SHARPINQ9H0F6 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SHARPINQ9H0F6 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SHARPINQ9H0F6 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SHARPINQ9H0F6 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SHARPINQ9H0F6 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SHARPINQ9H0F6 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SHARPINQ9H0F6 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SHARPINQ9H0F6 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SHARPINQ9H0F6 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SHARPINQ9H0F6 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SHARPINQ9H0F6 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SHARPINQ9H0F6 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SHARPINQ9H0F6 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SHARPINQ9H0F6 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SHARPINQ9H0F6 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SHARPINQ9H0F6 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SHARPINQ9H0F6 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SHARPINQ9H0F6 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SHARPINQ9H0F6 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SHARPINQ9H0F6 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SHARPINQ9H0F6 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SHARPINQ9H0F6 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SHARPINQ9H0F6 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SHARPINQ9H0F6 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SHARPINQ9H0F6 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SHARPINQ9H0F6 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SHARPINQ9H0F6 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SHARPINQ9H0F6 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SHARPINQ9H0F6 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SHARPINQ9H0F6 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SHARPINQ9H0F6 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SHARPINQ9H0F6 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SHARPINQ9H0F6 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SHARPINQ9H0F6 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SHARPINQ9H0F6 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SHARPINQ9H0F6 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SHARPINQ9H0F6 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SHARPINQ9H0F6 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SHARPINQ9H0F6 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SHARPINQ9H0F6 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SHARPINQ9H0F6 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SHARPINQ9H0F6 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SHARPINQ9H0F6 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SHARPINQ9H0F6 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SHARPINQ9H0F6 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SHARPINQ9H0F6 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SHARPINQ9H0F6 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SHARPINQ9H0F6 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SHARPINQ9H0F6 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SHARPINQ9H0F6 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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