Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D0

PHACTR1, Phosphatase and actin regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR1Q9C0D0 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHACTR1Q9C0D0 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHACTR1Q9C0D0 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHACTR1Q9C0D0 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHACTR1Q9C0D0 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHACTR1Q9C0D0 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHACTR1Q9C0D0 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHACTR1Q9C0D0 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHACTR1Q9C0D0 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHACTR1Q9C0D0 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHACTR1Q9C0D0 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHACTR1Q9C0D0 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PHACTR1Q9C0D0 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHACTR1Q9C0D0 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHACTR1Q9C0D0 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHACTR1Q9C0D0 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHACTR1Q9C0D0 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHACTR1Q9C0D0 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PHACTR1Q9C0D0 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHACTR1Q9C0D0 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHACTR1Q9C0D0 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHACTR1Q9C0D0 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHACTR1Q9C0D0 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PHACTR1Q9C0D0 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHACTR1Q9C0D0 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHACTR1Q9C0D0 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHACTR1Q9C0D0 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHACTR1Q9C0D0 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHACTR1Q9C0D0 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHACTR1Q9C0D0 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHACTR1Q9C0D0 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHACTR1Q9C0D0 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHACTR1Q9C0D0 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHACTR1Q9C0D0 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHACTR1Q9C0D0 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHACTR1Q9C0D0 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHACTR1Q9C0D0 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHACTR1Q9C0D0 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHACTR1Q9C0D0 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHACTR1Q9C0D0 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHACTR1Q9C0D0 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHACTR1Q9C0D0 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHACTR1Q9C0D0 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHACTR1Q9C0D0 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHACTR1Q9C0D0 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHACTR1Q9C0D0 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHACTR1Q9C0D0 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PHACTR1Q9C0D0 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHACTR1Q9C0D0 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHACTR1Q9C0D0 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHACTR1Q9C0D0 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHACTR1Q9C0D0 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHACTR1Q9C0D0 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHACTR1Q9C0D0 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHACTR1Q9C0D0 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHACTR1Q9C0D0 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHACTR1Q9C0D0 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHACTR1Q9C0D0 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHACTR1Q9C0D0 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHACTR1Q9C0D0 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHACTR1Q9C0D0 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PHACTR1Q9C0D0 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PHACTR1Q9C0D0 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PHACTR1Q9C0D0 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PHACTR1Q9C0D0 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PHACTR1Q9C0D0 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PHACTR1Q9C0D0 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PHACTR1Q9C0D0 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PHACTR1Q9C0D0 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PHACTR1Q9C0D0 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PHACTR1Q9C0D0 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PHACTR1Q9C0D0 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PHACTR1Q9C0D0 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PHACTR1Q9C0D0 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PHACTR1Q9C0D0 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PHACTR1Q9C0D0 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PHACTR1Q9C0D0 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PHACTR1Q9C0D0 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PHACTR1Q9C0D0 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PHACTR1Q9C0D0 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PHACTR1Q9C0D0 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PHACTR1Q9C0D0 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PHACTR1Q9C0D0 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PHACTR1Q9C0D0 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PHACTR1Q9C0D0 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PHACTR1Q9C0D0 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PHACTR1Q9C0D0 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PHACTR1Q9C0D0 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PHACTR1Q9C0D0 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PHACTR1Q9C0D0 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PHACTR1Q9C0D0 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PHACTR1Q9C0D0 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PHACTR1Q9C0D0 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PHACTR1Q9C0D0 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PHACTR1Q9C0D0 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PHACTR1Q9C0D0 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PHACTR1Q9C0D0 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PHACTR1Q9C0D0 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PHACTR1Q9C0D0 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PHACTR1Q9C0D0 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms