Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE9

CDHR2, Cadherin-related family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDHR2Q9BYE9 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDHR2Q9BYE9 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDHR2Q9BYE9 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDHR2Q9BYE9 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDHR2Q9BYE9 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDHR2Q9BYE9 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDHR2Q9BYE9 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDHR2Q9BYE9 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDHR2Q9BYE9 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDHR2Q9BYE9 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDHR2Q9BYE9 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDHR2Q9BYE9 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDHR2Q9BYE9 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDHR2Q9BYE9 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDHR2Q9BYE9 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDHR2Q9BYE9 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDHR2Q9BYE9 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDHR2Q9BYE9 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CDHR2Q9BYE9 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDHR2Q9BYE9 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDHR2Q9BYE9 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDHR2Q9BYE9 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDHR2Q9BYE9 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDHR2Q9BYE9 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDHR2Q9BYE9 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDHR2Q9BYE9 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDHR2Q9BYE9 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDHR2Q9BYE9 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDHR2Q9BYE9 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDHR2Q9BYE9 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CDHR2Q9BYE9 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDHR2Q9BYE9 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDHR2Q9BYE9 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDHR2Q9BYE9 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDHR2Q9BYE9 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDHR2Q9BYE9 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDHR2Q9BYE9 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDHR2Q9BYE9 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDHR2Q9BYE9 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDHR2Q9BYE9 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDHR2Q9BYE9 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDHR2Q9BYE9 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CDHR2Q9BYE9 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDHR2Q9BYE9 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDHR2Q9BYE9 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDHR2Q9BYE9 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDHR2Q9BYE9 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDHR2Q9BYE9 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDHR2Q9BYE9 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDHR2Q9BYE9 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDHR2Q9BYE9 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDHR2Q9BYE9 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDHR2Q9BYE9 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDHR2Q9BYE9 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDHR2Q9BYE9 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDHR2Q9BYE9 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDHR2Q9BYE9 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDHR2Q9BYE9 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDHR2Q9BYE9 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDHR2Q9BYE9 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDHR2Q9BYE9 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CDHR2Q9BYE9 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDHR2Q9BYE9 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDHR2Q9BYE9 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDHR2Q9BYE9 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDHR2Q9BYE9 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDHR2Q9BYE9 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDHR2Q9BYE9 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDHR2Q9BYE9 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDHR2Q9BYE9 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDHR2Q9BYE9 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDHR2Q9BYE9 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDHR2Q9BYE9 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDHR2Q9BYE9 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDHR2Q9BYE9 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDHR2Q9BYE9 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDHR2Q9BYE9 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDHR2Q9BYE9 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDHR2Q9BYE9 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDHR2Q9BYE9 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CDHR2Q9BYE9 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDHR2Q9BYE9 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDHR2Q9BYE9 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CDHR2Q9BYE9 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CDHR2Q9BYE9 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDHR2Q9BYE9 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDHR2Q9BYE9 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CDHR2Q9BYE9 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDHR2Q9BYE9 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDHR2Q9BYE9 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDHR2Q9BYE9 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDHR2Q9BYE9 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDHR2Q9BYE9 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDHR2Q9BYE9 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDHR2Q9BYE9 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDHR2Q9BYE9 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDHR2Q9BYE9 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDHR2Q9BYE9 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDHR2Q9BYE9 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDHR2Q9BYE9 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms