Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RNF17Q9BXT8 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
RNF17Q9BXT8 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RNF17Q9BXT8 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RNF17Q9BXT8 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RNF17Q9BXT8 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RNF17Q9BXT8 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RNF17Q9BXT8 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RNF17Q9BXT8 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RNF17Q9BXT8 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RNF17Q9BXT8 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RNF17Q9BXT8 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RNF17Q9BXT8 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RNF17Q9BXT8 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RNF17Q9BXT8 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RNF17Q9BXT8 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RNF17Q9BXT8 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RNF17Q9BXT8 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RNF17Q9BXT8 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RNF17Q9BXT8 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
RNF17Q9BXT8 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RNF17Q9BXT8 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RNF17Q9BXT8 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RNF17Q9BXT8 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RNF17Q9BXT8 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RNF17Q9BXT8 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RNF17Q9BXT8 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RNF17Q9BXT8 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RNF17Q9BXT8 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RNF17Q9BXT8 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RNF17Q9BXT8 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RNF17Q9BXT8 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RNF17Q9BXT8 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
RNF17Q9BXT8 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RNF17Q9BXT8 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RNF17Q9BXT8 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
RNF17Q9BXT8 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RNF17Q9BXT8 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RNF17Q9BXT8 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RNF17Q9BXT8 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RNF17Q9BXT8 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
RNF17Q9BXT8 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
RNF17Q9BXT8 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
RNF17Q9BXT8 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RNF17Q9BXT8 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RNF17Q9BXT8 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RNF17Q9BXT8 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RNF17Q9BXT8 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RNF17Q9BXT8 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RNF17Q9BXT8 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
RNF17Q9BXT8 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
RNF17Q9BXT8 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RNF17Q9BXT8 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RNF17Q9BXT8 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RNF17Q9BXT8 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RNF17Q9BXT8 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RNF17Q9BXT8 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RNF17Q9BXT8 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RNF17Q9BXT8 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RNF17Q9BXT8 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
RNF17Q9BXT8 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RNF17Q9BXT8 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RNF17Q9BXT8 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RNF17Q9BXT8 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RNF17Q9BXT8 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RNF17Q9BXT8 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RNF17Q9BXT8 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RNF17Q9BXT8 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RNF17Q9BXT8 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RNF17Q9BXT8 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RNF17Q9BXT8 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
RNF17Q9BXT8 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RNF17Q9BXT8 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RNF17Q9BXT8 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RNF17Q9BXT8 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RNF17Q9BXT8 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RNF17Q9BXT8 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RNF17Q9BXT8 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RNF17Q9BXT8 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RNF17Q9BXT8 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RNF17Q9BXT8 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RNF17Q9BXT8 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RNF17Q9BXT8 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RNF17Q9BXT8 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RNF17Q9BXT8 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RNF17Q9BXT8 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RNF17Q9BXT8 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RNF17Q9BXT8 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
RNF17Q9BXT8 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RNF17Q9BXT8 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RNF17Q9BXT8 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RNF17Q9BXT8 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RNF17Q9BXT8 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RNF17Q9BXT8 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RNF17Q9BXT8 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RNF17Q9BXT8 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RNF17Q9BXT8 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RNF17Q9BXT8 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RNF17Q9BXT8 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RNF17Q9BXT8 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms