Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SALL3Q9BXA9 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SALL3Q9BXA9 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SALL3Q9BXA9 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SALL3Q9BXA9 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SALL3Q9BXA9 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SALL3Q9BXA9 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SALL3Q9BXA9 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SALL3Q9BXA9 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SALL3Q9BXA9 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SALL3Q9BXA9 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SALL3Q9BXA9 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SALL3Q9BXA9 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SALL3Q9BXA9 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SALL3Q9BXA9 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SALL3Q9BXA9 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
SALL3Q9BXA9 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SALL3Q9BXA9 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SALL3Q9BXA9 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SALL3Q9BXA9 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SALL3Q9BXA9 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SALL3Q9BXA9 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SALL3Q9BXA9 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SALL3Q9BXA9 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SALL3Q9BXA9 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SALL3Q9BXA9 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SALL3Q9BXA9 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SALL3Q9BXA9 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
SALL3Q9BXA9 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SALL3Q9BXA9 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SALL3Q9BXA9 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SALL3Q9BXA9 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SALL3Q9BXA9 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SALL3Q9BXA9 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SALL3Q9BXA9 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SALL3Q9BXA9 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SALL3Q9BXA9 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SALL3Q9BXA9 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SALL3Q9BXA9 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SALL3Q9BXA9 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SALL3Q9BXA9 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SALL3Q9BXA9 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SALL3Q9BXA9 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SALL3Q9BXA9 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SALL3Q9BXA9 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SALL3Q9BXA9 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SALL3Q9BXA9 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SALL3Q9BXA9 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SALL3Q9BXA9 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SALL3Q9BXA9 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SALL3Q9BXA9 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SALL3Q9BXA9 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SALL3Q9BXA9 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SALL3Q9BXA9 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SALL3Q9BXA9 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SALL3Q9BXA9 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SALL3Q9BXA9 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SALL3Q9BXA9 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SALL3Q9BXA9 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SALL3Q9BXA9 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SALL3Q9BXA9 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SALL3Q9BXA9 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SALL3Q9BXA9 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SALL3Q9BXA9 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SALL3Q9BXA9 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SALL3Q9BXA9 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SALL3Q9BXA9 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SALL3Q9BXA9 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SALL3Q9BXA9 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SALL3Q9BXA9 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SALL3Q9BXA9 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SALL3Q9BXA9 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SALL3Q9BXA9 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SALL3Q9BXA9 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SALL3Q9BXA9 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SALL3Q9BXA9 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SALL3Q9BXA9 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SALL3Q9BXA9 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SALL3Q9BXA9 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SALL3Q9BXA9 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SALL3Q9BXA9 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SALL3Q9BXA9 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SALL3Q9BXA9 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SALL3Q9BXA9 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SALL3Q9BXA9 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SALL3Q9BXA9 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SALL3Q9BXA9 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SALL3Q9BXA9 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SALL3Q9BXA9 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SALL3Q9BXA9 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SALL3Q9BXA9 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SALL3Q9BXA9 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SALL3Q9BXA9 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SALL3Q9BXA9 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SALL3Q9BXA9 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SALL3Q9BXA9 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SALL3Q9BXA9 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SALL3Q9BXA9 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SALL3Q9BXA9 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SALL3Q9BXA9 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms