Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HIRIP3Q9BW71 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HIRIP3Q9BW71 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HIRIP3Q9BW71 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HIRIP3Q9BW71 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HIRIP3Q9BW71 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HIRIP3Q9BW71 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HIRIP3Q9BW71 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HIRIP3Q9BW71 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HIRIP3Q9BW71 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HIRIP3Q9BW71 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HIRIP3Q9BW71 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HIRIP3Q9BW71 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HIRIP3Q9BW71 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HIRIP3Q9BW71 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HIRIP3Q9BW71 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HIRIP3Q9BW71 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HIRIP3Q9BW71 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HIRIP3Q9BW71 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
HIRIP3Q9BW71 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HIRIP3Q9BW71 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HIRIP3Q9BW71 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HIRIP3Q9BW71 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HIRIP3Q9BW71 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HIRIP3Q9BW71 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HIRIP3Q9BW71 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HIRIP3Q9BW71 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HIRIP3Q9BW71 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HIRIP3Q9BW71 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HIRIP3Q9BW71 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HIRIP3Q9BW71 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
HIRIP3Q9BW71 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HIRIP3Q9BW71 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HIRIP3Q9BW71 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
HIRIP3Q9BW71 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HIRIP3Q9BW71 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HIRIP3Q9BW71 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
HIRIP3Q9BW71 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HIRIP3Q9BW71 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HIRIP3Q9BW71 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HIRIP3Q9BW71 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HIRIP3Q9BW71 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HIRIP3Q9BW71 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HIRIP3Q9BW71 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HIRIP3Q9BW71 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HIRIP3Q9BW71 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HIRIP3Q9BW71 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HIRIP3Q9BW71 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HIRIP3Q9BW71 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HIRIP3Q9BW71 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HIRIP3Q9BW71 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HIRIP3Q9BW71 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HIRIP3Q9BW71 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
HIRIP3Q9BW71 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HIRIP3Q9BW71 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HIRIP3Q9BW71 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HIRIP3Q9BW71 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HIRIP3Q9BW71 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HIRIP3Q9BW71 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HIRIP3Q9BW71 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HIRIP3Q9BW71 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HIRIP3Q9BW71 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HIRIP3Q9BW71 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HIRIP3Q9BW71 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HIRIP3Q9BW71 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HIRIP3Q9BW71 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HIRIP3Q9BW71 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HIRIP3Q9BW71 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
HIRIP3Q9BW71 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
HIRIP3Q9BW71 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HIRIP3Q9BW71 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HIRIP3Q9BW71 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HIRIP3Q9BW71 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HIRIP3Q9BW71 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
HIRIP3Q9BW71 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HIRIP3Q9BW71 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HIRIP3Q9BW71 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HIRIP3Q9BW71 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HIRIP3Q9BW71 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HIRIP3Q9BW71 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HIRIP3Q9BW71 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HIRIP3Q9BW71 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HIRIP3Q9BW71 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HIRIP3Q9BW71 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HIRIP3Q9BW71 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HIRIP3Q9BW71 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HIRIP3Q9BW71 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HIRIP3Q9BW71 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HIRIP3Q9BW71 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HIRIP3Q9BW71 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HIRIP3Q9BW71 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HIRIP3Q9BW71 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HIRIP3Q9BW71 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HIRIP3Q9BW71 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HIRIP3Q9BW71 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HIRIP3Q9BW71 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HIRIP3Q9BW71 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HIRIP3Q9BW71 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HIRIP3Q9BW71 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HIRIP3Q9BW71 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms