Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT78

COPS4, COP9 signalosome complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS4Q9BT78 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
COPS4Q9BT78 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
COPS4Q9BT78 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
COPS4Q9BT78 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
COPS4Q9BT78 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COPS4Q9BT78 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
COPS4Q9BT78 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
COPS4Q9BT78 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COPS4Q9BT78 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
COPS4Q9BT78 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COPS4Q9BT78 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COPS4Q9BT78 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
COPS4Q9BT78 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
COPS4Q9BT78 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
COPS4Q9BT78 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COPS4Q9BT78 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
COPS4Q9BT78 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COPS4Q9BT78 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COPS4Q9BT78 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
COPS4Q9BT78 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COPS4Q9BT78 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
COPS4Q9BT78 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
COPS4Q9BT78 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COPS4Q9BT78 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COPS4Q9BT78 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
COPS4Q9BT78 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COPS4Q9BT78 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
COPS4Q9BT78 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
COPS4Q9BT78 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
COPS4Q9BT78 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
COPS4Q9BT78 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
COPS4Q9BT78 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
COPS4Q9BT78 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COPS4Q9BT78 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COPS4Q9BT78 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COPS4Q9BT78 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
COPS4Q9BT78 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
COPS4Q9BT78 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COPS4Q9BT78 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COPS4Q9BT78 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COPS4Q9BT78 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COPS4Q9BT78 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COPS4Q9BT78 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COPS4Q9BT78 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
COPS4Q9BT78 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
COPS4Q9BT78 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COPS4Q9BT78 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COPS4Q9BT78 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COPS4Q9BT78 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
COPS4Q9BT78 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COPS4Q9BT78 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
COPS4Q9BT78 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
COPS4Q9BT78 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
COPS4Q9BT78 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COPS4Q9BT78 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
COPS4Q9BT78 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COPS4Q9BT78 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COPS4Q9BT78 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
COPS4Q9BT78 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COPS4Q9BT78 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
COPS4Q9BT78 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COPS4Q9BT78 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COPS4Q9BT78 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
COPS4Q9BT78 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COPS4Q9BT78 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
COPS4Q9BT78 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
COPS4Q9BT78 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
COPS4Q9BT78 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
COPS4Q9BT78 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COPS4Q9BT78 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COPS4Q9BT78 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COPS4Q9BT78 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
COPS4Q9BT78 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
COPS4Q9BT78 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms