Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF4

TIMM29, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim29, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM29Q9BSF4 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TIMM29Q9BSF4 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
TIMM29Q9BSF4 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
TIMM29Q9BSF4 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TIMM29Q9BSF4 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TIMM29Q9BSF4 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TIMM29Q9BSF4 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TIMM29Q9BSF4 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TIMM29Q9BSF4 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TIMM29Q9BSF4 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TIMM29Q9BSF4 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TIMM29Q9BSF4 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TIMM29Q9BSF4 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TIMM29Q9BSF4 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TIMM29Q9BSF4 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TIMM29Q9BSF4 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TIMM29Q9BSF4 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TIMM29Q9BSF4 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TIMM29Q9BSF4 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TIMM29Q9BSF4 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TIMM29Q9BSF4 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TIMM29Q9BSF4 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TIMM29Q9BSF4 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TIMM29Q9BSF4 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TIMM29Q9BSF4 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TIMM29Q9BSF4 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TIMM29Q9BSF4 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TIMM29Q9BSF4 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TIMM29Q9BSF4 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
TIMM29Q9BSF4 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
TIMM29Q9BSF4 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TIMM29Q9BSF4 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TIMM29Q9BSF4 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TIMM29Q9BSF4 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
TIMM29Q9BSF4 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TIMM29Q9BSF4 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TIMM29Q9BSF4 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TIMM29Q9BSF4 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TIMM29Q9BSF4 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TIMM29Q9BSF4 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TIMM29Q9BSF4 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TIMM29Q9BSF4 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TIMM29Q9BSF4 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TIMM29Q9BSF4 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TIMM29Q9BSF4 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TIMM29Q9BSF4 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TIMM29Q9BSF4 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TIMM29Q9BSF4 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
TIMM29Q9BSF4 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TIMM29Q9BSF4 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TIMM29Q9BSF4 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TIMM29Q9BSF4 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TIMM29Q9BSF4 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TIMM29Q9BSF4 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TIMM29Q9BSF4 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TIMM29Q9BSF4 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TIMM29Q9BSF4 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TIMM29Q9BSF4 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TIMM29Q9BSF4 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TIMM29Q9BSF4 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TIMM29Q9BSF4 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TIMM29Q9BSF4 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TIMM29Q9BSF4 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TIMM29Q9BSF4 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TIMM29Q9BSF4 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TIMM29Q9BSF4 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TIMM29Q9BSF4 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TIMM29Q9BSF4 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TIMM29Q9BSF4 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TIMM29Q9BSF4 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TIMM29Q9BSF4 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TIMM29Q9BSF4 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TIMM29Q9BSF4 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TIMM29Q9BSF4 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
TIMM29Q9BSF4 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TIMM29Q9BSF4 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TIMM29Q9BSF4 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TIMM29Q9BSF4 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TIMM29Q9BSF4 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TIMM29Q9BSF4 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TIMM29Q9BSF4 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TIMM29Q9BSF4 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TIMM29Q9BSF4 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TIMM29Q9BSF4 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TIMM29Q9BSF4 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TIMM29Q9BSF4 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TIMM29Q9BSF4 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
TIMM29Q9BSF4 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
TIMM29Q9BSF4 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.64■□□□□ 0.42
TIMM29Q9BSF4 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TIMM29Q9BSF4 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TIMM29Q9BSF4 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TIMM29Q9BSF4 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TIMM29Q9BSF4 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TIMM29Q9BSF4 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
TIMM29Q9BSF4 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TIMM29Q9BSF4 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
TIMM29Q9BSF4 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TIMM29Q9BSF4 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TIMM29Q9BSF4 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms