Protein–RNA interactions for Protein: Q96S65

CSRNP1, Cysteine/serine-rich nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP1Q96S65 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSRNP1Q96S65 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSRNP1Q96S65 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSRNP1Q96S65 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CSRNP1Q96S65 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSRNP1Q96S65 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CSRNP1Q96S65 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CSRNP1Q96S65 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CSRNP1Q96S65 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CSRNP1Q96S65 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CSRNP1Q96S65 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CSRNP1Q96S65 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CSRNP1Q96S65 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CSRNP1Q96S65 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CSRNP1Q96S65 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CSRNP1Q96S65 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CSRNP1Q96S65 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CSRNP1Q96S65 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CSRNP1Q96S65 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CSRNP1Q96S65 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CSRNP1Q96S65 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CSRNP1Q96S65 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CSRNP1Q96S65 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CSRNP1Q96S65 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CSRNP1Q96S65 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CSRNP1Q96S65 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CSRNP1Q96S65 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CSRNP1Q96S65 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CSRNP1Q96S65 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CSRNP1Q96S65 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CSRNP1Q96S65 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CSRNP1Q96S65 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CSRNP1Q96S65 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CSRNP1Q96S65 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CSRNP1Q96S65 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CSRNP1Q96S65 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CSRNP1Q96S65 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CSRNP1Q96S65 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CSRNP1Q96S65 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CSRNP1Q96S65 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CSRNP1Q96S65 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSRNP1Q96S65 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSRNP1Q96S65 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSRNP1Q96S65 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSRNP1Q96S65 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSRNP1Q96S65 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSRNP1Q96S65 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSRNP1Q96S65 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSRNP1Q96S65 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSRNP1Q96S65 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSRNP1Q96S65 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSRNP1Q96S65 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSRNP1Q96S65 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CSRNP1Q96S65 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CSRNP1Q96S65 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CSRNP1Q96S65 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSRNP1Q96S65 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSRNP1Q96S65 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSRNP1Q96S65 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSRNP1Q96S65 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSRNP1Q96S65 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSRNP1Q96S65 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSRNP1Q96S65 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSRNP1Q96S65 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSRNP1Q96S65 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSRNP1Q96S65 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CSRNP1Q96S65 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSRNP1Q96S65 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSRNP1Q96S65 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSRNP1Q96S65 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSRNP1Q96S65 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSRNP1Q96S65 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSRNP1Q96S65 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSRNP1Q96S65 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSRNP1Q96S65 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSRNP1Q96S65 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSRNP1Q96S65 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSRNP1Q96S65 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSRNP1Q96S65 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSRNP1Q96S65 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSRNP1Q96S65 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSRNP1Q96S65 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSRNP1Q96S65 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSRNP1Q96S65 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSRNP1Q96S65 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSRNP1Q96S65 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSRNP1Q96S65 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSRNP1Q96S65 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSRNP1Q96S65 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSRNP1Q96S65 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSRNP1Q96S65 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSRNP1Q96S65 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSRNP1Q96S65 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSRNP1Q96S65 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSRNP1Q96S65 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSRNP1Q96S65 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSRNP1Q96S65 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSRNP1Q96S65 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSRNP1Q96S65 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSRNP1Q96S65 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms