Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD4

TRIM47, Tripartite motif-containing protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM47Q96LD4 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM47Q96LD4 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM47Q96LD4 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM47Q96LD4 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM47Q96LD4 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM47Q96LD4 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM47Q96LD4 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM47Q96LD4 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM47Q96LD4 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM47Q96LD4 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM47Q96LD4 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM47Q96LD4 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM47Q96LD4 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM47Q96LD4 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM47Q96LD4 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM47Q96LD4 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM47Q96LD4 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM47Q96LD4 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM47Q96LD4 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM47Q96LD4 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM47Q96LD4 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM47Q96LD4 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM47Q96LD4 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM47Q96LD4 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM47Q96LD4 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM47Q96LD4 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM47Q96LD4 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM47Q96LD4 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM47Q96LD4 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM47Q96LD4 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM47Q96LD4 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM47Q96LD4 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM47Q96LD4 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM47Q96LD4 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM47Q96LD4 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM47Q96LD4 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM47Q96LD4 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM47Q96LD4 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM47Q96LD4 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM47Q96LD4 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM47Q96LD4 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM47Q96LD4 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM47Q96LD4 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM47Q96LD4 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM47Q96LD4 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM47Q96LD4 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM47Q96LD4 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM47Q96LD4 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM47Q96LD4 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM47Q96LD4 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM47Q96LD4 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM47Q96LD4 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM47Q96LD4 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM47Q96LD4 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM47Q96LD4 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM47Q96LD4 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM47Q96LD4 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM47Q96LD4 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM47Q96LD4 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM47Q96LD4 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM47Q96LD4 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM47Q96LD4 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM47Q96LD4 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM47Q96LD4 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM47Q96LD4 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM47Q96LD4 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM47Q96LD4 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM47Q96LD4 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM47Q96LD4 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM47Q96LD4 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM47Q96LD4 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM47Q96LD4 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM47Q96LD4 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM47Q96LD4 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM47Q96LD4 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM47Q96LD4 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM47Q96LD4 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM47Q96LD4 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM47Q96LD4 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM47Q96LD4 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM47Q96LD4 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM47Q96LD4 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM47Q96LD4 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM47Q96LD4 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
TRIM47Q96LD4 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
TRIM47Q96LD4 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIM47Q96LD4 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIM47Q96LD4 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIM47Q96LD4 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIM47Q96LD4 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIM47Q96LD4 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIM47Q96LD4 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIM47Q96LD4 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIM47Q96LD4 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIM47Q96LD4 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIM47Q96LD4 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIM47Q96LD4 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIM47Q96LD4 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIM47Q96LD4 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIM47Q96LD4 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms