Protein–RNA interactions for Protein: Q96JY6

PDLIM2, PDZ and LIM domain protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM2Q96JY6 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDLIM2Q96JY6 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDLIM2Q96JY6 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDLIM2Q96JY6 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDLIM2Q96JY6 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDLIM2Q96JY6 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDLIM2Q96JY6 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDLIM2Q96JY6 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDLIM2Q96JY6 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDLIM2Q96JY6 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDLIM2Q96JY6 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDLIM2Q96JY6 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDLIM2Q96JY6 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDLIM2Q96JY6 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDLIM2Q96JY6 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDLIM2Q96JY6 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDLIM2Q96JY6 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDLIM2Q96JY6 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDLIM2Q96JY6 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDLIM2Q96JY6 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDLIM2Q96JY6 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDLIM2Q96JY6 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDLIM2Q96JY6 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDLIM2Q96JY6 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDLIM2Q96JY6 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDLIM2Q96JY6 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDLIM2Q96JY6 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDLIM2Q96JY6 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDLIM2Q96JY6 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDLIM2Q96JY6 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDLIM2Q96JY6 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDLIM2Q96JY6 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDLIM2Q96JY6 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDLIM2Q96JY6 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDLIM2Q96JY6 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDLIM2Q96JY6 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDLIM2Q96JY6 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDLIM2Q96JY6 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDLIM2Q96JY6 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDLIM2Q96JY6 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDLIM2Q96JY6 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDLIM2Q96JY6 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDLIM2Q96JY6 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDLIM2Q96JY6 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDLIM2Q96JY6 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PDLIM2Q96JY6 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDLIM2Q96JY6 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDLIM2Q96JY6 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PDLIM2Q96JY6 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PDLIM2Q96JY6 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PDLIM2Q96JY6 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PDLIM2Q96JY6 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PDLIM2Q96JY6 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PDLIM2Q96JY6 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PDLIM2Q96JY6 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PDLIM2Q96JY6 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PDLIM2Q96JY6 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PDLIM2Q96JY6 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PDLIM2Q96JY6 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PDLIM2Q96JY6 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PDLIM2Q96JY6 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDLIM2Q96JY6 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDLIM2Q96JY6 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDLIM2Q96JY6 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDLIM2Q96JY6 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDLIM2Q96JY6 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PDLIM2Q96JY6 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDLIM2Q96JY6 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDLIM2Q96JY6 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDLIM2Q96JY6 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PDLIM2Q96JY6 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDLIM2Q96JY6 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDLIM2Q96JY6 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDLIM2Q96JY6 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDLIM2Q96JY6 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDLIM2Q96JY6 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDLIM2Q96JY6 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDLIM2Q96JY6 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDLIM2Q96JY6 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDLIM2Q96JY6 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDLIM2Q96JY6 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDLIM2Q96JY6 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDLIM2Q96JY6 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDLIM2Q96JY6 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDLIM2Q96JY6 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDLIM2Q96JY6 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDLIM2Q96JY6 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDLIM2Q96JY6 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDLIM2Q96JY6 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PDLIM2Q96JY6 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDLIM2Q96JY6 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDLIM2Q96JY6 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDLIM2Q96JY6 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDLIM2Q96JY6 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDLIM2Q96JY6 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDLIM2Q96JY6 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDLIM2Q96JY6 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDLIM2Q96JY6 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDLIM2Q96JY6 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDLIM2Q96JY6 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms