Protein–RNA interactions for Protein: Q96G23

CERS2, Ceramide synthase 2, humanhuman

Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CERS2Q96G23 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CERS2Q96G23 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CERS2Q96G23 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CERS2Q96G23 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CERS2Q96G23 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CERS2Q96G23 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CERS2Q96G23 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CERS2Q96G23 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CERS2Q96G23 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CERS2Q96G23 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CERS2Q96G23 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CERS2Q96G23 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CERS2Q96G23 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CERS2Q96G23 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CERS2Q96G23 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CERS2Q96G23 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CERS2Q96G23 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CERS2Q96G23 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CERS2Q96G23 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CERS2Q96G23 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CERS2Q96G23 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CERS2Q96G23 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CERS2Q96G23 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CERS2Q96G23 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CERS2Q96G23 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CERS2Q96G23 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CERS2Q96G23 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CERS2Q96G23 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CERS2Q96G23 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CERS2Q96G23 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CERS2Q96G23 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CERS2Q96G23 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CERS2Q96G23 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CERS2Q96G23 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CERS2Q96G23 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CERS2Q96G23 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CERS2Q96G23 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CERS2Q96G23 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CERS2Q96G23 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CERS2Q96G23 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CERS2Q96G23 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CERS2Q96G23 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CERS2Q96G23 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CERS2Q96G23 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CERS2Q96G23 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CERS2Q96G23 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CERS2Q96G23 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CERS2Q96G23 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CERS2Q96G23 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CERS2Q96G23 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CERS2Q96G23 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CERS2Q96G23 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CERS2Q96G23 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CERS2Q96G23 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CERS2Q96G23 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CERS2Q96G23 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CERS2Q96G23 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CERS2Q96G23 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CERS2Q96G23 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CERS2Q96G23 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CERS2Q96G23 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CERS2Q96G23 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CERS2Q96G23 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CERS2Q96G23 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CERS2Q96G23 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CERS2Q96G23 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CERS2Q96G23 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CERS2Q96G23 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CERS2Q96G23 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CERS2Q96G23 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CERS2Q96G23 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CERS2Q96G23 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CERS2Q96G23 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CERS2Q96G23 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CERS2Q96G23 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CERS2Q96G23 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CERS2Q96G23 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CERS2Q96G23 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CERS2Q96G23 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CERS2Q96G23 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CERS2Q96G23 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CERS2Q96G23 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CERS2Q96G23 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CERS2Q96G23 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CERS2Q96G23 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CERS2Q96G23 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CERS2Q96G23 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CERS2Q96G23 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CERS2Q96G23 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CERS2Q96G23 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CERS2Q96G23 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CERS2Q96G23 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CERS2Q96G23 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CERS2Q96G23 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CERS2Q96G23 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CERS2Q96G23 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CERS2Q96G23 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CERS2Q96G23 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CERS2Q96G23 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CERS2Q96G23 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms