Protein–RNA interactions for Protein: Q96CS3

FAF2, FAS-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAF2Q96CS3 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FAF2Q96CS3 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FAF2Q96CS3 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FAF2Q96CS3 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FAF2Q96CS3 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FAF2Q96CS3 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FAF2Q96CS3 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FAF2Q96CS3 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
FAF2Q96CS3 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FAF2Q96CS3 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FAF2Q96CS3 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FAF2Q96CS3 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FAF2Q96CS3 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FAF2Q96CS3 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FAF2Q96CS3 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FAF2Q96CS3 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FAF2Q96CS3 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FAF2Q96CS3 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FAF2Q96CS3 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
FAF2Q96CS3 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FAF2Q96CS3 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FAF2Q96CS3 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FAF2Q96CS3 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FAF2Q96CS3 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
FAF2Q96CS3 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FAF2Q96CS3 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
FAF2Q96CS3 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FAF2Q96CS3 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FAF2Q96CS3 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FAF2Q96CS3 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FAF2Q96CS3 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FAF2Q96CS3 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FAF2Q96CS3 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FAF2Q96CS3 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FAF2Q96CS3 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FAF2Q96CS3 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FAF2Q96CS3 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FAF2Q96CS3 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FAF2Q96CS3 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
FAF2Q96CS3 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
FAF2Q96CS3 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
FAF2Q96CS3 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
FAF2Q96CS3 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
FAF2Q96CS3 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
FAF2Q96CS3 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
FAF2Q96CS3 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
FAF2Q96CS3 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FAF2Q96CS3 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FAF2Q96CS3 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FAF2Q96CS3 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FAF2Q96CS3 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FAF2Q96CS3 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FAF2Q96CS3 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FAF2Q96CS3 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FAF2Q96CS3 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FAF2Q96CS3 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
FAF2Q96CS3 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FAF2Q96CS3 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FAF2Q96CS3 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FAF2Q96CS3 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FAF2Q96CS3 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FAF2Q96CS3 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FAF2Q96CS3 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FAF2Q96CS3 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FAF2Q96CS3 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FAF2Q96CS3 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FAF2Q96CS3 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FAF2Q96CS3 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FAF2Q96CS3 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FAF2Q96CS3 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FAF2Q96CS3 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FAF2Q96CS3 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FAF2Q96CS3 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FAF2Q96CS3 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FAF2Q96CS3 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FAF2Q96CS3 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FAF2Q96CS3 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FAF2Q96CS3 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FAF2Q96CS3 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FAF2Q96CS3 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FAF2Q96CS3 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FAF2Q96CS3 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FAF2Q96CS3 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FAF2Q96CS3 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FAF2Q96CS3 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FAF2Q96CS3 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FAF2Q96CS3 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FAF2Q96CS3 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FAF2Q96CS3 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FAF2Q96CS3 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
FAF2Q96CS3 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FAF2Q96CS3 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FAF2Q96CS3 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FAF2Q96CS3 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FAF2Q96CS3 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FAF2Q96CS3 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
FAF2Q96CS3 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FAF2Q96CS3 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FAF2Q96CS3 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FAF2Q96CS3 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms