Protein–RNA interactions for Protein: Q92995

USP13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP13Q92995 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
USP13Q92995 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
USP13Q92995 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
USP13Q92995 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
USP13Q92995 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
USP13Q92995 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
USP13Q92995 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
USP13Q92995 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
USP13Q92995 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
USP13Q92995 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
USP13Q92995 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
USP13Q92995 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
USP13Q92995 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
USP13Q92995 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
USP13Q92995 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
USP13Q92995 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
USP13Q92995 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
USP13Q92995 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
USP13Q92995 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
USP13Q92995 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
USP13Q92995 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
USP13Q92995 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
USP13Q92995 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
USP13Q92995 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
USP13Q92995 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
USP13Q92995 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
USP13Q92995 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
USP13Q92995 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
USP13Q92995 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
USP13Q92995 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
USP13Q92995 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
USP13Q92995 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
USP13Q92995 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
USP13Q92995 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
USP13Q92995 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
USP13Q92995 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
USP13Q92995 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
USP13Q92995 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
USP13Q92995 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
USP13Q92995 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
USP13Q92995 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
USP13Q92995 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
USP13Q92995 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
USP13Q92995 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
USP13Q92995 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
USP13Q92995 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
USP13Q92995 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
USP13Q92995 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
USP13Q92995 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
USP13Q92995 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
USP13Q92995 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
USP13Q92995 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
USP13Q92995 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
USP13Q92995 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
USP13Q92995 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
USP13Q92995 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
USP13Q92995 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
USP13Q92995 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
USP13Q92995 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
USP13Q92995 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
USP13Q92995 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
USP13Q92995 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
USP13Q92995 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
USP13Q92995 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
USP13Q92995 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
USP13Q92995 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
USP13Q92995 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
USP13Q92995 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
USP13Q92995 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
USP13Q92995 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
USP13Q92995 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
USP13Q92995 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
USP13Q92995 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
USP13Q92995 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
USP13Q92995 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
USP13Q92995 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
USP13Q92995 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
USP13Q92995 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
USP13Q92995 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
USP13Q92995 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
USP13Q92995 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
USP13Q92995 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
USP13Q92995 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
USP13Q92995 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
USP13Q92995 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
USP13Q92995 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
USP13Q92995 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
USP13Q92995 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
USP13Q92995 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
USP13Q92995 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC19■□□□□ 0.63
USP13Q92995 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
USP13Q92995 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
USP13Q92995 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
USP13Q92995 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
USP13Q92995 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
USP13Q92995 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
USP13Q92995 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
USP13Q92995 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
USP13Q92995 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
USP13Q92995 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92 ms