Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD5

MCOLN3, Mucolipin-3, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCOLN3Q8TDD5 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MCOLN3Q8TDD5 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MCOLN3Q8TDD5 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MCOLN3Q8TDD5 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MCOLN3Q8TDD5 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MCOLN3Q8TDD5 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MCOLN3Q8TDD5 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MCOLN3Q8TDD5 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MCOLN3Q8TDD5 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MCOLN3Q8TDD5 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MCOLN3Q8TDD5 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MCOLN3Q8TDD5 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MCOLN3Q8TDD5 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MCOLN3Q8TDD5 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MCOLN3Q8TDD5 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MCOLN3Q8TDD5 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MCOLN3Q8TDD5 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MCOLN3Q8TDD5 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MCOLN3Q8TDD5 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MCOLN3Q8TDD5 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MCOLN3Q8TDD5 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MCOLN3Q8TDD5 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MCOLN3Q8TDD5 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MCOLN3Q8TDD5 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MCOLN3Q8TDD5 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
MCOLN3Q8TDD5 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MCOLN3Q8TDD5 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MCOLN3Q8TDD5 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MCOLN3Q8TDD5 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MCOLN3Q8TDD5 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MCOLN3Q8TDD5 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MCOLN3Q8TDD5 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
MCOLN3Q8TDD5 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MCOLN3Q8TDD5 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MCOLN3Q8TDD5 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
MCOLN3Q8TDD5 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MCOLN3Q8TDD5 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MCOLN3Q8TDD5 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MCOLN3Q8TDD5 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MCOLN3Q8TDD5 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MCOLN3Q8TDD5 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MCOLN3Q8TDD5 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MCOLN3Q8TDD5 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MCOLN3Q8TDD5 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MCOLN3Q8TDD5 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MCOLN3Q8TDD5 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MCOLN3Q8TDD5 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MCOLN3Q8TDD5 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MCOLN3Q8TDD5 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MCOLN3Q8TDD5 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MCOLN3Q8TDD5 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MCOLN3Q8TDD5 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MCOLN3Q8TDD5 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MCOLN3Q8TDD5 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MCOLN3Q8TDD5 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MCOLN3Q8TDD5 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MCOLN3Q8TDD5 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MCOLN3Q8TDD5 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MCOLN3Q8TDD5 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MCOLN3Q8TDD5 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MCOLN3Q8TDD5 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
MCOLN3Q8TDD5 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MCOLN3Q8TDD5 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MCOLN3Q8TDD5 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MCOLN3Q8TDD5 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MCOLN3Q8TDD5 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MCOLN3Q8TDD5 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MCOLN3Q8TDD5 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MCOLN3Q8TDD5 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MCOLN3Q8TDD5 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MCOLN3Q8TDD5 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MCOLN3Q8TDD5 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MCOLN3Q8TDD5 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MCOLN3Q8TDD5 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MCOLN3Q8TDD5 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MCOLN3Q8TDD5 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MCOLN3Q8TDD5 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MCOLN3Q8TDD5 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MCOLN3Q8TDD5 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MCOLN3Q8TDD5 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MCOLN3Q8TDD5 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MCOLN3Q8TDD5 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MCOLN3Q8TDD5 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MCOLN3Q8TDD5 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MCOLN3Q8TDD5 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MCOLN3Q8TDD5 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MCOLN3Q8TDD5 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MCOLN3Q8TDD5 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MCOLN3Q8TDD5 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MCOLN3Q8TDD5 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MCOLN3Q8TDD5 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MCOLN3Q8TDD5 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MCOLN3Q8TDD5 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MCOLN3Q8TDD5 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
MCOLN3Q8TDD5 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MCOLN3Q8TDD5 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MCOLN3Q8TDD5 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MCOLN3Q8TDD5 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MCOLN3Q8TDD5 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
MCOLN3Q8TDD5 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms