Protein–RNA interactions for Protein: Q8N944

AMER3, APC membrane recruitment protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMER3Q8N944 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms