Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.81□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC12.8□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC12.79□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms